RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 TUBA1CQ9BQE3 449 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 RAD21L1Q9H4I0 556 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 A1L4Q6 167 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 SNX3O60493 162 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 NTN1O95631 604 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 CSTAP01040 98 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 GCKP35557 465 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 HPCAP84074 193 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 SRYQ05066 204 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 XKRXQ6PP77 449 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 PLXDC2Q6UX71 529 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB8AQ96BR9 441 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 CCDC106Q9BWC9 280 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 BCL2L10Q9HD36 194 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 MRGBPQ9NV56 204 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 RNF6Q9Y252 685 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 CHST2Q9Y4C5 530 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 LOC100653049A0A140TA62 436 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 LINC01387J3KSC0 135 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 FXYD1O00168 92 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 KRT34O76011 436 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 ARAFP10398 606 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 PEPDP12955 493 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 ZNF17P17021 662 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 IL11P20809 199 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 PPIBP23284 216 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 SMSP52788 366 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 CRISP3P54108 245 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 CLDN20P56880 219 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 GGNQ86UU5 652 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 RND1Q92730 232 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 UCN2Q96RP3 112 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 AP4B1Q9Y6B7 739 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 A0A0G2JNJ9 132 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 A0A0G2JPF8 293 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 CD8B2A6NJW9 211 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 SLC22A2O15244 555 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 PRKCAP17252 672 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 FOXF1Q12946 379 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 NFYCQ13952 458 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A53Q5H9E4 307 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 COQ5Q5HYK3 327 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 SNX32Q86XE0 403 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 VRK2Q86Y07 508 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 NAXEQ8NCW5 288 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 TNIP2Q8NFZ5 429 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 RNF145Q96MT1 663 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 DOCK7Q96N67 2140 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 FAM107BQ9H098 131 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 MYLK2Q9H1R3 596 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 CALHM2Q9HA72 323 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 CALML5Q9NZT1 146 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 Q9UFV3 132 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 CACNA1CQ13936 2221 aa20.09■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 H3BML4 177 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 PGM3O95394 542 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 DBIP07108 87 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 NID1P14543 1247 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 TIMP3P35625 211 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 GZMMP51124 257 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 DLX5P56178 289 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 MTPNP58546 118 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 ART3Q13508 389 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 QPRTQ15274 297 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 GCNT6Q5T4J0 391 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 REP15Q6BDI9 236 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 POMZP3Q6PJE2 187 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 PIGWQ7Z7B1 504 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 PTOV1Q86YD1 416 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 TREML1Q86YW5 311 aa20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms