RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000055006.11

Trim16-201, Transcript of Tripartite motif-containing protein 16, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trim16, Length 3,906 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim16-201ENSMUST00000055006 Cdk5P49615 292 aa7.31□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Mrpl10Q3TBW2 262 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Ffar3Q3UFD7 319 aa7.31□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Slc47a2Q3V050 573 aa7.31□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gm906Q3V0M1 1017 aa7.31□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Epha1Q60750 977 aa7.31□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Hs3st2Q673U1 367 aa7.31□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Eid2Q6X7S9 236 aa7.31□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr298Q7TS06 332 aa7.31□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 MkxQ8BIA3 353 aa7.31□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Pou6f2Q8BJI4 691 aa7.31□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Banf2Q8BVR0 90 aa7.31□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Lysmd4Q8CC84 293 aa7.31□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Hpf1Q8CFE2 346 aa7.31□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr164Q8VF87 315 aa7.31□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr109Q8VG96 314 aa7.31□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr658Q8VGV5 323 aa7.31□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 ScgnQ91WD9 276 aa7.31□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Camk2gQ923T9 529 aa7.31□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 NaxdQ9CZ42 343 aa7.31□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Fbxl12Q9EPX5 326 aa7.31□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Sp6Q9ESX2 376 aa7.31□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 ReckQ9Z0J1 971 aa7.31□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Unc80Q8BLN6 3261 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gm29776A0A286YEC0 699 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Cldn34aG3UW52 211 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Amd1P0DMN7 334 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Hoxd8P23463 289 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Bcl2a1Q07440 172 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Acss3Q14DH7 682 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 CltbQ6IRU5 229 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr871Q7TRF0 311 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Timm29Q8BGX2 266 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Ces2eQ8BK48 559 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Leng9Q8BTN6 485 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Wdfy2Q8BUB4 400 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Pomgnt2Q8BW41 605 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Clrn1Q8K445 232 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Ubqln1Q8R317 582 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr1426Q8VG74 311 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr525Q8VGL5 309 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Q91W34 466 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Zfand2bQ91X58 257 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Q9CQF4 240 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Ephx1Q9D379 455 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Ttc9bQ9D6E4 239 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Pebp4Q9D9G2 242 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr705Q9EPF7 316 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr44Q9EQB8 314 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Sgk3Q9ERE3 496 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gde1Q9JL56 331 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Dock11A2AF47 2073 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Dcst2A0A140LIJ0 701 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gm4779A0A1B0GR91 561 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Wdr76A6PWY4 622 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Cd101A8E0Y8 1033 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Vmn2r105E9Q3A5 860 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Cyp2d37-psF6YKB5 150 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 H2-T24F8VQG4 363 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Pcdh12O55134 1180 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Apoa2P09813 102 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 OtcP11725 354 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Cdh4P39038 913 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Plin2P43883 425 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gnb5P62881 395 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Cmklr1P97468 371 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Pitx2P97474 317 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Kdm4dQ3U2K5 510 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 DmknQ6P253 517 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Tmed3Q78IS1 221 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr1231Q7TQZ8 313 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 1700001K19RikQ80ZT1 219 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Mfsd11Q8BJ51 449 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Trmt6Q8CE96 497 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Mmp28Q8CGV8 520 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Rfwd3Q8CIK8 774 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Dcun1d3Q8K0V2 304 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Bcl7bQ921K9 202 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Mrm2Q9CPY0 246 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Actl11Q9D5V1 1207 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Fam69aQ9D6I7 428 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Slc23a2Q9EPR4 648 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Stub1Q9WUD1 304 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Ak4Q9WUR9 223 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Srpk3Q9Z0G2 565 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gm4924A0A1B0GR71 966 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Mamdc4A2AJA7 1228 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr1056A2AVY0 313 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Zfp945E9PYM8 794 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Dscr3O35075 297 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Cd14P10810 366 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 SnrpbP27048 231 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gal3st3P61315 431 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 HbegfQ06186 208 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Defb43Q30KM9 69 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Tcfl5Q32NY8 489 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Xkr5Q5GH66 676 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Bdkrb1Q61125 334 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Laptm5Q61168 261 aa7.3□□□□□ -1.24
Trim16-201ENSMUST00000055006 Znf354aQ61751 572 aa7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.9 ms