RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000004430.13

Clcn3-201, Transcript of H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clcn3, Length 4,175 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Fam189bQ5HZJ5 669 aa12□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 E2f1Q61501 430 aa12□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Snap91Q61548 901 aa12□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Lrrn1Q61809 716 aa12□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr1463Q7TQR3 310 aa12□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Q8BR90 294 aa12□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Banf2Q8BVR0 90 aa12□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Cpne1Q8C166 536 aa12□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Unc5dQ8K1S2 956 aa12□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr669Q8VGU9 317 aa12□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Aph1cQ9DCZ9 258 aa12□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Cd209fD3Z1H5 274 aa12□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr723E9PZU2 309 aa12□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 PtprhE9Q0N2 971 aa12□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr724K7N5X7 309 aa12□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Hif3aQ0VBL6 662 aa12□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 PtprjQ64455 1238 aa12□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Hamp2Q80T19 83 aa12□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Tmem184bQ8BG09 407 aa12□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Ptcd2Q8R3K3 381 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Mlf2Q99KX1 247 aa12□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Pebp4Q9D9G2 242 aa12□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Xrn2Q9DBR1 951 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Cd302Q9DCG2 228 aa12□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Adam21Q9JI76 729 aa12□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Cyp4a30bA0A087WS15 508 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm20911A0A087WSS0 222 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Hoxc8P09025 242 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Chrnb1P09690 501 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Cntn1P12960 1020 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Atp1b1P14094 304 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Itgb7P26011 806 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Tbx6P70327 436 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Spata6Q3U6K5 488 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 CmahQ61419 577 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Tas2r143Q7TQB9 293 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr1275Q7TQY8 312 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Pgm2Q7TSV4 620 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Rbm48Q8K2X2 371 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Q8R3C1 574 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Fam69bQ99ML4 431 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Pcm1Q9R0L6 2025 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gdf2Q9WV56 428 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Rhox2fA2ANE0 191 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Vmn2r105E9Q3A5 860 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm11239E9Q5Z9 360 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm11237F2Z3W5 360 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm11238F2Z478 360 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Hax1O35387 280 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Ptpn22P29352 802 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Slc1a3P56564 543 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Fut7Q11131 389 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm428Q3UTE2 360 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm11487Q5RIS0 354 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 N6amt1Q6SKR2 214 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Kctd9Q80UN1 339 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Slc25a12Q8BH59 677 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Tspan12Q8BKT6 305 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Csnk1g3Q8C4X2 424 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Slc22a12Q8CFZ5 553 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Mmp28Q8CGV8 520 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Slc35b4Q8CIA5 331 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Erlec1Q8VEH8 483 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr656Q8VGX9 329 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Eps8l3Q91WL0 600 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Slc22a17Q9D9E0 401 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 CroccQ8CJ40 2009 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Enthd1E9Q1Z2 618 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm3594E9Q2A7 267 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr1360K9J6X0 313 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 IlkO55222 452 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Smpd2O70572 419 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 UrodP70697 367 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Itgb2lQ3UV74 738 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm12258Q5NC63 627 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Taar8aQ5QD07 344 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 CelQ64285 599 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr1359Q7TQU5 313 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Oscp1Q8BHW2 379 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Tctn1Q8BZ64 593 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 NotumQ8R116 503 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Sirt4Q8R216 333 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr768Q8VGC4 312 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Lims2Q91XD2 341 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Slc25a37Q920G8 338 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Spred1Q924S8 444 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Tmem176aQ9DCS1 244 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Elovl4Q9EQC4 312 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Klhl1Q9JI74 751 aa11.99□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr576A0A0G2JFH3 312 aa11.98□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 4930402F06RikA2AUQ8 332 aa11.98□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Zfp616J3QN14 987 aa11.98□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr1513L7N457 313 aa11.98□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Clec10aP49300 304 aa11.98□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr629Q0VBH3 314 aa11.98□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Cmpk2Q3U5Q7 447 aa11.98□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Mtcp1Q60945 107 aa11.98□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Eci3Q78JN3 317 aa11.98□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Olfr298Q7TS06 332 aa11.98□□□□□ -0.49
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Acsm4Q80W40 580 aa11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.1 ms