RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637003.1

ARID1B-222, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

TSL 5 BASIC

Gene ARID1B, Length 1,290 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-222	ENST00000637003	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	PTPN13	Q12923	2485 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003		H0Y3Z8	333 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003		H3BNH8	94 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	ANGPT2	O15123	496 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	SEC14L5	O43304	696 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	NUDT14	O95848	222 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	BCHE	P06276	602 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	UBL4A	P11441	157 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	MSX1	P28360	303 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	KLF10	Q13118	480 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	RGN	Q15493	299 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	EID3	Q8N140	333 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	POC1B	Q8TC44	478 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	RND1	Q92730	232 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	MAL2	Q969L2	176 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	ARMCX1	Q9P291	453 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	LIPT1	Q9Y234	373 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARID1B-222	ENST00000637003	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	AHRR	A9YTQ3	701 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF264	O43296	627 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	KRT34	O76011	436 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	CSTA	P01040	98 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	TFPT	P0C1Z6	253 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	GABRA1	P14867	456 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	IL11	P20809	199 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	CHM	P24386	653 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	P2RX1	P51575	399 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	CLDN15	P56746	228 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	CLDN18	P56856	261 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	CLDN20	P56880	219 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	GNGT1	P63211	74 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	FOXF1	Q12946	379 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	SELPLG	Q14242	412 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	TMEM19	Q96HH6	336 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	RNF145	Q96MT1	663 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	UCK2	Q9BZX2	261 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	FREM3	P0C091	2139 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003		A0A0G2JNJ9	132 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	PRSS44	E7EML9	344 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	FBP2	O00757	339 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	TOX	O94900	526 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	LINGO3	P0C6S8	592 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	PEPD	P12955	493 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	CPN1	P15169	458 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF708	P17019	499 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	PLAUR	Q03405	335 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	NFYC	Q13952	458 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	FGFBP1	Q14512	234 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	VRK2	Q86Y07	508 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	FBXO27	Q8NI29	283 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	GPR119	Q8TDV5	335 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	POLE3	Q9NRF9	147 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ARID1B-222	ENST00000637003		Q9UFV3	132 aa		13.69	□□□□□ -0.22

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