RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		12.16	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		12.16	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		12.16	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		12.15	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		12.15	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		12.15	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	UNC119B	A6NIH7	251 aa		12.15	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	GABRP	O00591	440 aa		12.15	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	TNFSF14	O43557	240 aa		12.15	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	12.15	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	12.15	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	12.15	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	12.15	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	SCN1B	Q07699	218 aa		12.15	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	EIPR1	Q53HC9	387 aa		12.15	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		12.15	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		12.15	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		12.15	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF649	Q9BS31	505 aa		12.15	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	12.15	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	HPGDS	O60760	199 aa		12.15	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	NID1	P14543	1247 aa		12.15	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	HTR3A	P46098	478 aa		12.15	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	FHL5	Q5TD97	284 aa		12.15	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		12.15	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		12.15	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		12.15	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		12.15	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	12.15	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		12.15	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	IFT27	Q9BW83	186 aa		12.15	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		12.15	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	SPACA6	W5XKT8	324 aa		12.15	□□□□□ -0.46
BRF1-222	ENST00000635152	CDHR4	A6H8M9	788 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	CYR61	O00622	381 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	HR	O43593	1189 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	RDH16	O75452	317 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	GPR75	O95800	540 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	HLA-DPB1	P04440	258 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	HMGN1	P05114	100 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	CLU	P10909	449 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	GPR50	Q13585	617 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	CLDND1	Q9NY35	253 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	SCML1	Q9UN30	329 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	OR2W5	A6NFC9	320 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	C2orf74	A8MZ97	194 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	GNB5	O14775	395 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	ATP1B1	P05026	303 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	KRT8	P05787	483 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	P2RY14	Q15391	338 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	XKRX	Q6PP77	449 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	RAB43	Q86YS6	212 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM99	Q8N816	258 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	SETD6	Q8TBK2	473 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	AP3S1	Q92572	193 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152		A6NL46	340 aa		12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	RFPL3	O75679	317 aa		12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	GYPB	P06028	91 aa		12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	THBS1	P07996	1170 aa		12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	AKT2	P31751	481 aa		12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	FZD5	Q13467	585 aa		12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	12.13	□□□□□ -0.47	7e-6	■■■■□ 19.9
BRF1-222	ENST00000635152	NNAT	Q16517	81 aa		12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	SMUG1	Q53HV7	270 aa		12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	VASN	Q6EMK4	673 aa		12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	CNIH2	Q6PI25	160 aa		12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	DTX3	Q8N9I9	347 aa		12.13	□□□□□ -0.47

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