RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	PCDH7	O60245	1069 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	FBP1	P09467	338 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	NAT2	P11245	290 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	NAGA	P17050	411 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	SAT1	P21673	171 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	EPHA3	P29320	983 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	STT3A	P46977	705 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	BTN3A2	P78410	334 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	CCL8	P80075	99 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	HGFAC	Q04756	655 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	ITIH4	Q14624	930 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	LCE3B	Q5TA77	95 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	FCRLA	Q7L513	359 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	CCNY	Q8ND76	341 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	FBXO27	Q8NI29	283 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	DOK4	Q8TEW6	326 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	OSTF1	Q92882	214 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	NEURL3	Q96EH8	262 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	OR5M11	Q96RB7	305 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	NABP2	Q9BQ15	211 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	DSN1	Q9H410	356 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	RAB18	Q9NP72	206 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	CACNG2	Q9Y698	323 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A0U1RQV1	116 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC189	A1A4V9	331 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	AQP7P3	A6NL99	342 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	P2RY10	O00398	339 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	CCL22	O00626	93 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	ADAMDEC1	O15204	470 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	OR1F1	O43749	312 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	UGT2B11	O75310	529 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHV1-69	P01742	117 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	OPN1LW	P04000	364 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP1A3	P13637	1013 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	PSMB4	P28070	264 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	ARHGAP25	P42331	645 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	GIPR	P48546	466 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	THBS3	P49746	956 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	GDF10	P55107	478 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	WNT3A	P56704	352 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	PLIN5	Q00G26	463 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	PAX2	Q02962	417 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC3A1	Q07837	685 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	GBX1	Q14549	363 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	LGSN	Q5TDP6	509 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	CASC4	Q6P4E1	433 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440		Q8N3U1	123 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	TMCO6	Q96DC7	493 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	MUC13	Q9H3R2	512 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	BCO1	Q9HAY6	547 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	EHD3	Q9NZN3	535 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	SORL1	Q92673	2214 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A1W2PPW3	197 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	NUDT19	A8MXV4	375 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440		B4DXG7	233 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-223	ENST00000627440	C4orf51	C9J302	202 aa		5.07	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms