RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592578.5

PSME3-215, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 4

Gene PSME3, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-215	ENST00000592578	VDAC3	Q9Y277	283 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF175	Q9Y473	711 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578		A0A087WZY1	265 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	WDR91	A4D1P6	747 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	MSTN	O14793	375 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	TM9SF1	O15321	606 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	BIRC5	O15392	142 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	CFLAR	O15519	480 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	TNFSF13	O75888	250 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	SERPINE1	P05121	402 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	KRT16	P08779	473 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	PAX1	P15863	534 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF17	P17021	662 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	ATP6V1C1	P21283	382 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	CRYGS	P22914	178 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	PCYT1A	P49585	367 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	CLDN15	P56746	228 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	CLDN20	P56880	219 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	CHI3L2	Q15782	390 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	ETFDH	Q16134	617 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	SGCB	Q16585	318 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	SMU1	Q2TAY7	513 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	CDC73	Q6P1J9	531 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	ZAR1	Q86SH2	424 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	GATS	Q8NAP1	163 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	FIG4	Q92562	907 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	MOAP1	Q96BY2	351 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578		A0A1W2PQD3	144 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578		H0YC42	278 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	ITM2A	O43736	263 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	C6orf47	O95873	294 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	TUBB	P07437	444 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	MYZAP	P0CAP1	466 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	G6PD	P11413	515 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	FCGR2A	P12318	317 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	CLDN8	P56748	225 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	EMX2	Q04743	252 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	TNK1	Q13470	666 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	TP53BP2	Q13625	1128 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	VEZF1	Q14119	521 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	FGFBP1	Q14512	234 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	PON3	Q15166	354 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	CROCCP2	Q86T23	111 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	SFXN5	Q8TD22	340 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	CDS1	Q92903	461 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	STARD4	Q96DR4	205 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	DUSP26	Q9BV47	211 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	CENPH	Q9H3R5	247 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	RNF122	Q9H9V4	155 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	RAB21	Q9UL25	225 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	ZAN	Q9Y493	2812 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	C21orf58	P58505	322 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF527	Q8NB42	609 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	PGM2	Q96G03	612 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36

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