RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586268.5

NEDD4L-215, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene NEDD4L, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-215	ENST00000586268	DCST1	Q5T197	706 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	WLS	Q5T9L3	541 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	LYPD8	Q6UX82	237 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	LINC00471	Q8N535	108 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	AMER2	Q8N7J2	671 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	OR52J3	Q8NH60	311 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	IP6K3	Q96PC2	410 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	ZNF559	Q9BR84	538 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	RHCG	Q9UBD6	479 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	CEP250	Q9BV73	2442 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	CYP7B1	O75881	506 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	CELA2A	P08217	269 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	FBXO45	P0C2W1	286 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	LIPC	P11150	499 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	UBL4A	P11441	157 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	PRG2	P13727	222 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	IGFBP5	P24593	272 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	HTR2A	P28223	471 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	DAP	P51397	102 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	RAD23A	P54725	363 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	HOXC5	Q00444	222 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	CHAF1B	Q13112	559 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	IL10RA	Q13651	578 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	ZNF613	Q6PF04	617 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	RNF138	Q8WVD3	245 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	TTC9	Q92623	222 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	HGD	Q93099	445 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	ADI1	Q9BV57	179 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	TRIM2	Q9C040	744 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	FADS1	O60427	444 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	SERPINA7	P05543	415 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	GKN3P	P0CG01	181 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	FUT4	P22083	530 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	CBL	P22681	906 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	EVI2B	P34910	448 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	MERTK	Q12866	999 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	SKP2	Q13309	424 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	OR1Q1	Q15612	314 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	CD226	Q15762	336 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	APOOL	Q6UXV4	268 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	MISP	Q8IVT2	679 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	SLC5A8	Q8N695	610 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	TFAP2C	Q92754	450 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	SLC38A4	Q969I6	547 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	TMCO6	Q96DC7	493 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	RASL10B	Q96S79	203 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	LAT2	Q9GZY6	243 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	SPEG	Q15772	3267 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268		H0YAE9	185 aa		12.78	□□□□□ -0.36
NEDD4L-215	ENST00000586268	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36

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