RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 VPS8Q8N3P4 1428 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 MAPKBP1O60336 1514 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 KIF14Q15058 1648 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1W2PQM1 296 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 NKX6-3A6NJ46 265 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 SAGE2PA6NJ88 616 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 USP27XA6NNY8 438 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 H3BNX3 289 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 K7EP13 123 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 M0R036 132 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 KCNK1O00180 336 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 P2RY10O00398 339 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 BHLHE40O14503 412 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 KLF11O14901 512 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 RAB29O14966 203 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 CTDSPLO15194 276 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 PSTPIP1O43586 416 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 PAGE4O60829 102 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 OR6A2O95222 327 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 VAPBO95292 243 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 PSMG1O95456 288 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 AP2A1O95782 977 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 BCL10O95999 233 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 OAS1P00973 400 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 TCRBP04435 133 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 PRKCGP05129 697 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 ACSM4P0C7M7 580 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 CETPP11597 493 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 FCGR1AP12314 374 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 IFI30P13284 250 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 GTF2F2P13984 249 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 UCHL3P15374 230 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 TPH1P17752 444 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 SPI1P17947 270 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 TSPAN8P19075 237 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 S1PR1P21453 382 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 FPR1P21462 350 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 GPD1P21695 349 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 PCMT1P22061 227 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 MST1P26927 711 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 PSMB5P28074 263 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 HTR2AP28223 471 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 KDELR2P33947 212 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 CPOXP36551 454 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 GABRA4P48169 554 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 IDH2P48735 452 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 FMO5P49326 533 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 CYB561P49447 251 aa2.82□□□□□ -1.96
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PTPRM-204ENST00000577468 HTR6P50406 440 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 HLCSP50747 726 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 CCR6P51684 374 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 PLA2G16P53816 162 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 TPTEP56180 551 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 LGALS4P56470 323 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 KCNK10P57789 538 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 TAS2R39P59534 338 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 ZP1P60852 638 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 LSM6P62312 80 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 SORDQ00796 357 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 RBPJQ06330 500 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 AESQ08117 197 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 SELENBP1Q13228 472 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 BIKQ13323 160 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 GRM4Q14833 912 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 GPNMBQ14956 572 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 OXA1LQ15070 435 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 CDK10Q15131 360 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 OR4D1Q15615 310 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 CARTPTQ16568 116 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 CDO1Q16878 200 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 QRICH1Q2TAL8 776 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 ZBED5Q49AG3 693 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 VPS26BQ4G0F5 336 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 SLC35D3Q5M8T2 416 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF569Q5MCW4 686 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 DNLZQ5SXM8 178 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 OR2G6Q5TZ20 316 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 C9orf135Q5VTT2 229 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 RESP18Q5W5W9 173 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 RHBDD2Q6NTF9 364 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 UGT3A1Q6NUS8 523 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 H3F3CQ6NXT2 135 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 LPCAT3Q6P1A2 487 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRM-204ENST00000577468 SLC27A1Q6PCB7 646 aa2.82□□□□□ -1.96
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