RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556370.1

AC005479.2-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC005479.2, Length 589 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC005479.2-201ENST00000556370 C9orf40Q8IXQ3 194 aa10.1□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 HS3ST5Q8IZT8 346 aa10.1□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 ZNF786Q8N393 782 aa10.1□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 SLC38A9Q8NBW4 561 aa10.1□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 APCDD1LQ8NCL9 501 aa10.1□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 OR4D11Q8NGI4 311 aa10.1□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 OR8J1Q8NGP2 316 aa10.1□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 M1APQ8TC57 530 aa10.1□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 TMCO6Q96DC7 493 aa10.1□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 ZNF700Q9H0M5 742 aa10.1□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 RIBC2Q9H4K1 309 aa10.1□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 IMPAD1Q9NX62 359 aa10.1□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 BAIAP2Q9UQB8 552 aa10.1□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 DTX4Q9Y2E6 619 aa10.1□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 CACNA1BQ00975 2339 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 A0A087WUU8 490 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 A6NHS1 94 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 J3KTA2 159 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 PEX12O00623 359 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 ZNF264O43296 627 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 TSPAN2O60636 221 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 MMP11P24347 488 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 CRHBPP24387 322 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 ABCD3P28288 659 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 MSX1P28360 303 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 HTR3AP46098 478 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 SLC9A3P48764 834 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 SMSP52788 366 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 DLX5P56178 289 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 SNTA1Q13424 505 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 TUBA3CQ13748 450 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 TMEM201Q5SNT2 666 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 CCNJQ5T5M9 372 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 SLX4IPQ5VYV7 408 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 PLAG1Q6DJT9 500 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 WBP2NLQ6ICG8 309 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 PODNL1Q6PEZ8 512 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 ZNF773Q6PK81 442 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 KLHL17Q6TDP4 642 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 GDF7Q7Z4P5 450 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 MRGPREQ86SM8 312 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 LACC1Q8IV20 430 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 P3H2Q8IVL5 708 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 CLIP4Q8N3C7 705 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 SVOPQ8N4V2 548 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 SIMC1Q8NDZ2 872 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 OR52J3Q8NH60 311 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 TEX47Q8TBZ9 253 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 RNF138Q8WVD3 245 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 FCGR1BQ92637 280 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 ARSGQ96EG1 525 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 TMEM43Q9BTV4 400 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 NUDT9Q9BW91 350 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 LAT2Q9GZY6 243 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 MMP25Q9NPA2 562 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 IL20Q9NYY1 176 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 KCNE5Q9UJ90 142 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 PADI1Q9ULC6 663 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 MED31Q9Y3C7 131 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 DMDP11532 3685 aa10.09□□□□□ -0.79
AC005479.2-201ENST00000556370 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa10.08□□□□□ -0.8
AC005479.2-201ENST00000556370 HRKO00198 91 aa10.08□□□□□ -0.8
AC005479.2-201ENST00000556370 SLC1A7O00341 560 aa10.08□□□□□ -0.8
AC005479.2-201ENST00000556370 KLF4O43474 513 aa10.08□□□□□ -0.8
AC005479.2-201ENST00000556370 STK17BO94768 372 aa10.08□□□□□ -0.8
AC005479.2-201ENST00000556370 RCBTB2O95199 551 aa10.08□□□□□ -0.8
AC005479.2-201ENST00000556370 UTS2O95399 124 aa10.08□□□□□ -0.8
AC005479.2-201ENST00000556370 ANGPTL1O95841 491 aa10.08□□□□□ -0.8
AC005479.2-201ENST00000556370 MT-CO3P00414 261 aa10.08□□□□□ -0.8
AC005479.2-201ENST00000556370 GASTP01350 101 aa10.08□□□□□ -0.8
AC005479.2-201ENST00000556370 IGKV1D-16P01601 117 aa10.08□□□□□ -0.8
AC005479.2-201ENST00000556370 PIPP12273 146 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
AC005479.2-201ENST00000556370 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
AC005479.2-201ENST00000556370 ID4P47928 161 aa10.08□□□□□ -0.8
AC005479.2-201ENST00000556370 IL5RAQ01344 420 aa10.08□□□□□ -0.8
AC005479.2-201ENST00000556370 PRKCDQ05655 676 aa10.08□□□□□ -0.8
AC005479.2-201ENST00000556370 CD47Q08722 323 aa10.08□□□□□ -0.8
AC005479.2-201ENST00000556370 SKP2Q13309 424 aa10.08□□□□□ -0.8
AC005479.2-201ENST00000556370 RAPSNQ13702 412 aa10.08□□□□□ -0.8
AC005479.2-201ENST00000556370 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
AC005479.2-201ENST00000556370 OR1Q1Q15612 314 aa10.08□□□□□ -0.8
AC005479.2-201ENST00000556370 MAPK14Q16539 360 aa10.08□□□□□ -0.8
AC005479.2-201ENST00000556370 SLC27A4Q6P1M0 643 aa10.08□□□□□ -0.8
AC005479.2-201ENST00000556370 CASP12Q6UXS9 341 aa10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms