RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547216.1

ARHGAP9-208, Transcript of Rho GTPase activating protein 9, human

TSL 4

Gene ARHGAP9, Length 587 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ZG16B	Q96DA0	208 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	NODAL	Q96S42	347 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ZNF347	Q96SE7	839 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ARHGDIG	Q99819	225 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	11.13	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216		K7EM74	188 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216		M0R3H8	397 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	GNGT2	O14610	69 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TPST1	O60507	370 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SLC25A12	O75746	678 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CEACAM4	O75871	244 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SNX4	O95219	450 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	NUDT14	O95848	222 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	WDPCP	O95876	746 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CD46	P15529	392 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	OR1E2	P47887	323 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	COPZ1	P61923	177 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	NFATC3	Q12968	1075 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	OR1C1	Q15619	314 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	NRF1	Q16656	503 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	DEF8	Q6ZN54	512 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	MARCH3	Q86UD3	253 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PACS2	Q86VP3	889 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	GRHL3	Q8TE85	626 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CHID1	Q9BWS9	393 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	S100A14	Q9HCY8	104 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	RLIM	Q9NVW2	624 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SELENON	Q9NZV5	590 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CLDN24	A6NM45	220 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216		H0Y3Z8	333 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ADAMDEC1	O15204	470 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	FMO6P	O60774	539 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	KRT36	O76013	467 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SEMG1	P04279	462 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CCL3	P10147	92 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	FAS	P25445	335 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	MSX1	P28360	303 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CD96	P40200	585 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CASP3	P42574	277 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	MAGEA2	P43356	314 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TAS2R41	P59536	307 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	KCNAB2	Q13303	367 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SKP2	Q13309	424 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CBFB	Q13951	182 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	RCN1	Q15293	331 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CD226	Q15762	336 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	DESI1	Q6ICB0	168 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	RNF138	Q8WVD3	245 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ZNF597	Q96LX8	424 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ZNF559	Q9BR84	538 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TRIM2	Q9C040	744 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	LAT2	Q9GZY6	243 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		11.11	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms