RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512656.1

USP46-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

TSL 3

Gene USP46, Length 467 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-208ENST00000512656 LTBQ06643 244 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-208ENST00000512656 FAM27E3Q08E93 113 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-208ENST00000512656 C17orf67Q0P5P2 114 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-208ENST00000512656 STX5Q13190 355 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-208ENST00000512656 SGCBQ16585 318 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-208ENST00000512656 ZNF385BQ569K4 471 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-208ENST00000512656 FAM71E1Q6IPT2 247 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-208ENST00000512656 PRSS57Q6UWY2 283 aa6.46□□□□□ -1.38
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USP46-208ENST00000512656 DUSP19Q8WTR2 217 aa6.46□□□□□ -1.38
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USP46-208ENST00000512656 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa6.46□□□□□ -1.38
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USP46-208ENST00000512656 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
USP46-208ENST00000512656 KLHL28Q9NXS3 571 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-208ENST00000512656 MED11Q9P086 117 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-208ENST00000512656 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
USP46-208ENST00000512656 PROCRQ9UNN8 238 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-208ENST00000512656 EMC9Q9Y3B6 208 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-208ENST00000512656 ZNF337Q9Y3M9 751 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-208ENST00000512656 TIMM22Q9Y584 194 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-208ENST00000512656 AP4B1Q9Y6B7 739 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-208ENST00000512656 MED12LQ86YW9 2145 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-208ENST00000512656 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa6.46□□□□□ -1.38
USP46-208ENST00000512656 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-208ENST00000512656 TMEM82A0PJX8 343 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-208ENST00000512656 H3BML4 177 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-208ENST00000512656 GOLGA8RI6L899 631 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-208ENST00000512656 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
USP46-208ENST00000512656 UPK1AO00322 258 aa6.45□□□□□ -1.38
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USP46-208ENST00000512656 SEC22BO75396 215 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-208ENST00000512656 UTS2O95399 124 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-208ENST00000512656 PSMG1O95456 288 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-208ENST00000512656 ANGPTL1O95841 491 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-208ENST00000512656 PLGP00747 810 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
USP46-208ENST00000512656 HEXAP06865 529 aa6.45□□□□□ -1.38
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USP46-208ENST00000512656 DDX5P17844 614 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
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USP46-208ENST00000512656 ZYG11AQ6WRX3 759 aa6.45□□□□□ -1.38
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USP46-208ENST00000512656 MARCH3Q86UD3 253 aa6.45□□□□□ -1.38
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USP46-208ENST00000512656 ELP4Q96EB1 424 aa6.45□□□□□ -1.38
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USP46-208ENST00000512656 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
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USP46-208ENST00000512656 CCL19Q99731 98 aa6.45□□□□□ -1.38
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USP46-208ENST00000512656 GSTO2Q9H4Y5 243 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-208ENST00000512656 UBTD1Q9HAC8 227 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-208ENST00000512656 GLRX2Q9NS18 164 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-208ENST00000512656 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
USP46-208ENST00000512656 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
USP46-208ENST00000512656 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
USP46-208ENST00000512656 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-208ENST00000512656 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
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