RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	ASPDH	A6ND91	283 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193		A8MVJ9	347 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	DISC1	C4P0D8	188 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	PLPP1	O14494	284 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	APOC3	P02656	99 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	SCG5	P05408	212 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	SLC6A12	P48065	614 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	PRKX	P51817	358 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	AQP6	Q13520	282 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ELOC	Q15369	112 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	SGCB	Q16585	318 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	7.55	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF385B	Q569K4	471 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	THRSP	Q92748	146 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ACER3	Q9NUN7	267 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	POT1	Q9NUX5	634 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	MEMO1	Q9Y316	297 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	CACNG2	Q9Y698	323 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		7.55	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	NHS	Q6T4R5	1651 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	CENPBD1	B2RD01	187 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	SDC3	O75056	442 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ETHE1	O95571	254 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	SEMA4F	O95754	770 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	UQCRC1	P31930	480 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ARHGDIB	P52566	201 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	SQSTM1	Q13501	440 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	OR1Q1	Q15612	314 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	CDNF	Q49AH0	187 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM234	Q8WY98	164 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	C7orf34	Q96L11	122 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	OR51J1	Q9H342	316 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	COPZ2	Q9P299	210 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	SOCS6	O14544	535 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	CS	O75390	466 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	IFNA21	P01568	189 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	MMP11	P24347	488 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	MAOB	P27338	520 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	GJA4	P35212	333 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	KCNJ10	P78508	379 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	GALK2	Q01415	458 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ERV3-1	Q14264	604 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	PLK5	Q496M5	336 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	PGC	P20142	388 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	SHC1	P29353	583 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	OXA1L	Q15070	435 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	RPE65	Q16518	533 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	SGCA	Q16586	387 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ALG10	Q5BKT4	473 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	CARD17	Q5XLA6	110 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193		Q6ZSR6	202 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	STX12	Q86Y82	276 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		7.54	□□□□□ -1.2
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		7.54	□□□□□ -1.2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms