RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495399.1

C9orf135-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 135, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135, Length 502 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-204ENST00000495399 GIMAP4Q9NUV9 329 aa6.74□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 ZIM2Q9NZV7 527 aa6.74□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa6.74□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 WIF1Q9Y5W5 379 aa6.74□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 A0A087WV62 115 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 A0A1W2PRB8 838 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 GMNCA6NCL1 334 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 OVOL3O00110 214 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 UPK1AO00322 258 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 PLOD3O60568 738 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 HCN1O60741 890 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 SLC22A3O75751 556 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 C6orf47O95873 294 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 C1QCP02747 245 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 IFI6P09912 130 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 NTSP30990 170 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 EMDP50402 254 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 ATP4BP51164 291 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 ARFIP2P53365 341 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 HBA1P69905 142 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 HSPB3Q12988 150 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 EBPQ15125 230 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 DPY19L1Q2PZI1 675 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 PGS1Q32NB8 556 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 RNF111Q6ZNA4 994 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 ANKRD46Q86W74 232 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 MIER2Q8N344 545 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 OR2L13Q8N349 312 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF441Q8N8Z8 693 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 OR7G1Q8NGA0 311 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 OR52R1Q8NGF1 315 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 OR8K3Q8NH51 312 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 ADIPOR1Q96A54 375 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 ELP4Q96EB1 424 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 GIMAP5Q96F15 307 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 ART5Q96L15 291 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 SGCZQ96LD1 299 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 ITPAQ9BY32 194 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 ANGPTL4Q9BY76 406 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 WWTR1Q9GZV5 400 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 RABEP2Q9H5N1 569 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 CXorf36Q9H7Y0 433 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 SERHLQ9NQF3 203 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 SLC6A13Q9NSD5 602 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 ATAD3AQ9NVI7 634 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 GALNT8Q9NY28 637 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 NTMQ9P121 344 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 COPS7AQ9UBW8 275 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 MAPRE3Q9UPY8 281 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 RNF114Q9Y508 228 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 FAM234BA2RU67 622 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 OR6C76A6NM76 312 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 SNX3O60493 162 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 TMCC2O75069 709 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 SLITRK5O94991 958 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 CT45A8P0DMV1 189 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 CT45A9P0DMV2 189 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 SRD5A1P18405 259 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 CRYGSP22914 178 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 IGFBP5P24593 272 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 PTPN6P29350 595 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 S100A3P33764 101 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 MAP3K8P41279 467 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 CDKN2CP42773 168 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 KCNJ2P63252 427 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 GAB1Q13480 694 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 RCAN2Q14206 197 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 SQLEQ14534 574 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 RPS6KA2Q15349 733 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 TMEM249Q2WGJ8 235 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 MIDNQ504T8 468 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 CT45A2Q5DJT8 189 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 PIGGQ5H8A4 983 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 C6orf163Q5TEZ5 329 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 PRAMEF20Q5VT98 475 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 LIPNQ5VXI9 398 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 METTL21CQ5VZV1 264 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 OPN5Q6U736 354 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 NPSR1Q6W5P4 371 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 IL17RELQ6ZVW7 336 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 SPATA21Q7Z572 469 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 PIGWQ7Z7B1 504 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 CLEC4FQ8N1N0 589 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf135-204ENST00000495399 FBXW8Q8N3Y1 598 aa6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms