RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479554.5

ATG4B-218, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-218ENST00000479554 MTORP42345 2549 aa12.91□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 SHISA8B8ZZ34 492 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 CASKO14936 926 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 PEX11AO75192 247 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 KCNK2O95069 426 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 HRGP04196 525 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 ALOX5P09917 674 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 FCGR2AP12318 317 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 HPGDP15428 266 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF17P17021 662 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 PRIM2P49643 509 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 KEAP1Q14145 624 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 FGFBP1Q14512 234 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 DUSP5Q16690 384 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 TMEM44Q2T9K0 475 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 UGT3A2Q3SY77 523 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 XKR7Q5GH72 579 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 METTL21CQ5VZV1 264 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 FIGNL1Q6PIW4 674 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 METTL25Q8N6Q8 603 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 GATSQ8NAP1 163 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 OR4C3Q8NH37 302 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 MBD6Q96DN6 1003 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 C16orf58Q96GQ5 468 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 TMUB1Q9BVT8 246 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 NMUR2Q9GZQ4 415 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 RNF122Q9H9V4 155 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 TCF7L2Q9NQB0 619 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 STOML1Q9UBI4 398 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 GIMAP2Q9UG22 337 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 ATP6V1HQ9UI12 483 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 TRIM33Q9UPN9 1127 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 TESMINQ9Y4I5 508 aa12.9□□□□□ -0.34
ATG4B-218ENST00000479554 A0A087WZY1 265 aa12.89□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 SCDO00767 359 aa12.89□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 ATE1O95260 518 aa12.89□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 TBXA2RP21731 343 aa12.89□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 LCN1P31025 176 aa12.89□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 CD79BP40259 229 aa12.89□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 FAM27E3Q08E93 113 aa12.89□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 MLC1Q15049 377 aa12.89□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 SGCBQ16585 318 aa12.89□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa12.89□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa12.89□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 PPP4R4Q6NUP7 873 aa12.89□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 BTLAQ7Z6A9 289 aa12.89□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 ZAR1Q86SH2 424 aa12.89□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 GGNQ86UU5 652 aa12.89□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 MISPQ8IVT2 679 aa12.89□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 FNDC5Q8NAU1 212 aa12.89□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 OR7A2PQ8NGA2 310 aa12.89□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 FAM110BQ8TC76 370 aa12.89□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 C1orf50Q9BV19 199 aa12.89□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 NUF2Q9BZD4 464 aa12.89□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa12.89□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 UBQLN4Q9NRR5 601 aa12.89□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 ATAD3AQ9NVI7 634 aa12.89□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 SNX8Q9Y5X2 465 aa12.89□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 A0A1W2PRB8 838 aa12.88□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 ANKRD65E5RJM6 399 aa12.88□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 KLK2P20151 261 aa12.88□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 KCNJ5P48544 419 aa12.88□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 PCYT1AP49585 367 aa12.88□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 RASSF2P50749 326 aa12.88□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 NCALDP61601 193 aa12.88□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 PTGR1Q14914 329 aa12.88□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 DEFB113Q30KQ7 82 aa12.88□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 CCNJQ5T5M9 372 aa12.88□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 ACTRT2Q8TDY3 377 aa12.88□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 CDS1Q92903 461 aa12.88□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 ZBTB8AQ96BR9 441 aa12.88□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 NSL1Q96IY1 281 aa12.88□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 STACQ99469 402 aa12.88□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 SLC39A3Q9BRY0 314 aa12.88□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 MED18Q9BUE0 208 aa12.88□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 BTBD2Q9BX70 525 aa12.88□□□□□ -0.35
ATG4B-218ENST00000479554 PRRG4Q9BZD6 226 aa12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms