RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	KLF10	Q13118	480 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	FGFBP1	Q14512	234 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	SYPL1	Q16563	259 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC120	Q96HB5	630 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	CGREF1	Q99674	301 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	LAT2	Q9GZY6	243 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	CACNA1C	Q13936	2221 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241		A0A0G2JPF8	293 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	SNX3	O60493	162 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	CSTA	P01040	98 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	CHRM4	P08173	479 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	NPIPA8	P0DM63	369 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	PEPD	P12955	493 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF708	P17019	499 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	DRD4	P21917	467 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ELK4	P28324	431 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	LHX2	P50458	406 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	CHRNE	Q04844	493 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	CBFB	Q13951	182 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	NFYC	Q13952	458 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	RETREG3	Q86VR2	466 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF614	Q8N883	585 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ANKFN1	Q8N957	763 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	GATS	Q8NAP1	163 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	OR5W2	Q8NH69	310 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	UCN2	Q96RP3	112 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	SH3GL1	Q99961	368 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	CALHM2	Q9HA72	323 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	MED17	Q9NVC6	651 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	DOCK7	Q96N67	2140 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	OR2M5	A3KFT3	312 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	CD8B2	A6NJW9	211 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	C17orf51	A8MQB3	221 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	EPPIN	O95925	133 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	C1QC	P02747	245 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	BCHE	P06276	602 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	THBS1	P07996	1170 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	NID1	P14543	1247 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	TIMP3	P35625	211 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	PGM1	P36871	562 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	SLC6A8	P48029	635 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	SEC24C	P53992	1094 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	DLX5	P56178	289 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	KCNJ10	P78508	379 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	SKP2	Q13309	424 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	MAPK11	Q15759	364 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	RAET1L	Q5VY80	246 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	LACC1	Q8IV20	430 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	BBS10	Q8TAM1	723 aa		13.24	□□□□□ -0.29

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