RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 RGS4P49798 205 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 EMP1P54849 157 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SCAPQ12770 1279 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SV2CQ496J9 727 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 FFAR4Q5NUL3 377 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OR2T5Q6IEZ7 315 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 LCN8Q6JVE9 175 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CHADLQ6NUI6 762 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ENPP7Q6UWV6 458 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 KMT5CQ86Y97 462 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 LRRC18Q8N456 261 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 PLPP7Q8NBV4 271 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 STEAP2Q8NFT2 490 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OR4F6Q8NGB9 312 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OR2T29Q8NH02 315 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CHURC1Q8WUH1 139 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ASB5Q8WWX0 329 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CHFRQ96EP1 664 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OR52E6Q96RD3 313 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SERINC2Q96SA4 455 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 PTPN18Q99952 460 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OR12D3Q9UGF7 316 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 PKP3Q9Y446 797 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 A0A0B4J2A0 478 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1W2PS29 197 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SLC5A10A0PJK1 596 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 WDR27A2RRH5 827 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 MEIS3P2A8K0S8 358 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 DCTN6O00399 190 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 NRP1O14786 923 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SLC16A8O95907 504 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 EGFP01133 1207 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 IFNA1P01562 189 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 MBPP02686 304 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 HSD3B1P14060 373 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 NDUFV2P19404 249 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 AKT2P31751 481 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 RPL22P35268 128 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 EIF6P56537 245 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 LCN6P62502 163 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 IFITM3Q01628 133 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ECH1Q13011 328 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 PMS2P11Q13670 270 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 KIAA0895LQ68EN5 471 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TSSK4Q6SA08 328 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 IL34Q6ZMJ4 242 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 RNF165Q6ZSG1 346 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ZFPM1Q8IX07 1006 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ZMIZ2Q8NF64 920 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OR56A1Q8NGH5 318 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CASTOR1Q8WTX7 329 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 HAS2Q92819 552 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 MS4A10Q96PG2 267 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 KCNH6Q9H252 994 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 MS4A12Q9NXJ0 267 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 EPHA6Q9UF33 1036 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 FAM198AQ9UFP1 575 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SHPKQ9UHJ6 478 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 UGGT2Q9NYU1 1516 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CPDO75976 1380 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 PTPRJQ12913 1337 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC187A0A096LP49 1063 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OR5G3P0C626 314 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 DHRS4L1P0CG22 281 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 PNMTP11086 282 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 PTPRAP18433 802 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CD34P28906 385 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SLC6A8P48029 635 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 BCAT1P54687 386 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 MFAP4P55083 255 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SMIM11AP58511 58 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 DLK1P80370 383 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 AESQ08117 197 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 IL24Q13007 206 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CTF1Q16619 201 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP5.27□□□□□ -1.577e-6■■□□□ 14.4
PTPRC-209ENST00000442510 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ADCK2Q7Z695 626 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 NIT1Q86X76 327 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 BAGE3Q86Y29 109 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 BAGE2Q86Y30 109 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 PRSS35Q8N3Z0 413 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 KCNRGQ8N5I3 272 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ACBD7Q8N6N7 88 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF516Q92618 1163 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CD101Q93033 1021 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 UCN3Q969E3 161 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
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