RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427193.1

C9orf3-205, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 704 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-205ENST00000427193 CLGNO14967 610 aa5.05□□□□□ -1.6
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C9orf3-205ENST00000427193 DUX1O43812 170 aa5.05□□□□□ -1.6
C9orf3-205ENST00000427193 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
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C9orf3-205ENST00000427193 KRT6BP04259 564 aa5.05□□□□□ -1.6
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C9orf3-205ENST00000427193 CMTM7Q96FZ5 175 aa5.05□□□□□ -1.6
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C9orf3-205ENST00000427193 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
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C9orf3-205ENST00000427193 RNF224P0DH78 156 aa5.04□□□□□ -1.6
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C9orf3-205ENST00000427193 ALDH4A1P30038 563 aa5.04□□□□□ -1.6
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C9orf3-205ENST00000427193 ATP4BP51164 291 aa5.04□□□□□ -1.6
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C9orf3-205ENST00000427193 HMGCS1Q01581 520 aa5.04□□□□□ -1.6
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C9orf3-205ENST00000427193 C16orf72Q14CZ0 275 aa5.04□□□□□ -1.6
C9orf3-205ENST00000427193 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
C9orf3-205ENST00000427193 RBBP7Q16576 425 aa5.04□□□□□ -1.6
C9orf3-205ENST00000427193 TBRG1Q3YBR2 411 aa5.04□□□□□ -1.6
C9orf3-205ENST00000427193 GALNTL6Q49A17 601 aa5.04□□□□□ -1.6
C9orf3-205ENST00000427193 TMEM35AQ53FP2 167 aa5.04□□□□□ -1.6
C9orf3-205ENST00000427193 TMEM198Q66K66 360 aa5.04□□□□□ -1.6
C9orf3-205ENST00000427193 CAMKMTQ7Z624 323 aa5.04□□□□□ -1.6
C9orf3-205ENST00000427193 FUNDC1Q8IVP5 155 aa5.04□□□□□ -1.6
C9orf3-205ENST00000427193 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa5.04□□□□□ -1.6
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