RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRAF3Q13114 568 aa14.54□□□□□ -0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KLC3Q6P597 504 aa14.54□□□□□ -0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DEF8Q6ZN54 512 aa14.54□□□□□ -0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MISPQ8IVT2 679 aa14.54□□□□□ -0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CTAGE3PQ8IX95 158 aa14.54□□□□□ -0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR52N5Q8NH56 324 aa14.54□□□□□ -0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POC1BQ8TC44 478 aa14.54□□□□□ -0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PSD2Q9BQI7 771 aa14.54□□□□□ -0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SOX7Q9BT81 388 aa14.54□□□□□ -0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BPESC1Q9GZL8 116 aa14.54□□□□□ -0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF696Q9H7X3 374 aa14.54□□□□□ -0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VPS29Q9UBQ0 182 aa14.54□□□□□ -0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC25A15Q9Y619 301 aa14.54□□□□□ -0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CIB4A0PJX0 185 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 M0R1B8 84 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PSMG1O95456 288 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CDC25BP30305 580 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHN2P52757 468 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PHC1P78364 1004 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DEFA6Q01524 100 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHRNEQ04844 493 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC29A2Q14542 456 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF100Q8IYN0 542 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR4F6Q8NGB9 312 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SORCS2Q96PQ0 1159 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OSBPL9Q96SU4 736 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CXorf36Q9H7Y0 433 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NTMQ9P121 344 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRIM77I1YAP6 450 aa14.52□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UPK1AO00322 258 aa14.52□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAD51DO75771 328 aa14.52□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LINGO3P0C6S8 592 aa14.52□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HPGDP15428 266 aa14.52□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SHC1P29353 583 aa14.52□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GABRA3P34903 492 aa14.52□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DR1Q01658 176 aa14.52□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SWI5Q1ZZU3 235 aa14.52□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM107Q6UX40 140 aa14.52□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR2L13Q8N349 312 aa14.52□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZFP90Q8TF47 636 aa14.52□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCTPQ9UKL6 214 aa14.52□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMCO1Q9UM00 188 aa14.52□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRP5LA4QPB2 252 aa14.51□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCT8L1PA6NM43 557 aa14.51□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF724A8MTY0 619 aa14.51□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MYO1GB0I1T2 1018 aa14.51□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TP73O15350 636 aa14.51□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCDH7O60245 1069 aa14.51□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KLHL2O95198 593 aa14.51□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OTCP00480 354 aa14.51□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 JUNP05412 331 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HSD3B1P14060 373 aa14.51□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ENPP1P22413 925 aa14.51□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HSD3B2P26439 372 aa14.51□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GSTM5P46439 218 aa14.51□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAC3P60763 192 aa14.51□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa14.51□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZSWIM7Q19AV6 140 aa14.51□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VPS26BQ4G0F5 336 aa14.51□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FBXW9Q5XUX1 488 aa14.51□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR7E24Q6IFN5 339 aa14.51□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RINLQ6ZS11 566 aa14.51□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa14.51□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GALNT5Q7Z7M9 940 aa14.51□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MMGT1Q8N4V1 131 aa14.51□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GATSQ8NAP1 163 aa14.51□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR4C3Q8NH37 302 aa14.51□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa14.51□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FBXO17Q96EF6 278 aa14.51□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GRID1Q9ULK0 1009 aa14.51□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa14.5□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF195O14628 629 aa14.5□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STX16O14662 325 aa14.5□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGKV1D-16P01601 117 aa14.5□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C2P06681 752 aa14.5□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GSTA2P09210 222 aa14.5□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TACSTD2P09758 323 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms