RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCG5Q9H222 651 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 NUDT15Q9NV35 164 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CARNS1A5YM72 827 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CYR61O00622 381 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 DPP4P27487 766 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 POU1F1P28069 291 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ARPC4P59998 168 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GGTLC2Q14390 218 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ST3GAL2Q16842 350 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 RPTNQ6XPR3 784 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TIGD4Q8IY51 512 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SYS1Q8N2H4 156 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC44A3Q8N4M1 653 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 NEIL3Q8TAT5 605 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GATAD2BQ8WXI9 593 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 RADILQ96JH8 1075 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PRDM9Q9NQV7 894 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ENAMQ9NRM1 1142 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TOR4AQ9NXH8 423 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 COPS3Q9UNS2 423 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 WNT6Q9Y6F9 365 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FGF2P09038 288 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 NT5EP21589 574 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 P2RY2P41231 377 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GSTM5P46439 218 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 H2BFSP57053 126 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB8AP61006 207 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ARSIQ5FYB1 569 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 LY6G6FQ5SQ64 297 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 VRK2Q86Y07 508 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ACOT4Q8N9L9 421 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM71CQ8NEG0 241 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GSX2Q9BZM3 304 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CA10Q9NS85 328 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 KLHL20Q9Y2M5 609 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A0G2JPF8 293 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 C12orf71A8MTZ7 269 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC30A4O14863 429 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TNFSF14O43557 240 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2B3O76000 313 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP1R3DO95685 299 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TCRBP04435 133 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PEPDP12955 493 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ADRB3P13945 408 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PDX1P52945 283 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 DHCR24Q15392 516 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 NHLRC1Q6VVB1 395 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 IDO2Q6ZQW0 420 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 USP53Q70EK8 1073 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MRGPRFQ96AM1 343 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 EMC7Q9NPA0 242 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ACKR4Q9NPB9 350 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SEMA3GQ9NS98 782 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 HSPB11Q9Y547 144 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A0B4J203 849 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MFSD2BA6NFX1 497 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 NID1P14543 1247 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 AHRP35869 848 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MAP2K6P52564 334 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CDK5R1Q15078 307 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 DEF8Q6ZN54 512 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM122BQ7Z309 247 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 LIPHQ8WWY8 451 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CYYR1Q96J86 154 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 OR52D1Q9H346 318 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 NRIP3Q9NQ35 241 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM5Q9Y2B1 443 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 DCTN6O00399 190 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CTDSPLO15194 276 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SH3BP5O60239 455 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 UPK3AO75631 287 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CD83Q01151 205 aa3.35□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
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