RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379215.8

ECHDC3-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC3, Length 1,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-201ENST00000379215 EVI2BP34910 448 aa22.54■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 IFNGR2P38484 337 aa22.54■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 IL10RAQ13651 578 aa22.54■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 NHSL2Q5HYW2 709 aa22.54■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 KDM4DQ6B0I6 523 aa22.54■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 NXPE2Q96DL1 559 aa22.54■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC41A3Q96GZ6 507 aa22.54■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 ADI1Q9BV57 179 aa22.54■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 DENRO43583 198 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 GKN3PP0CG01 181 aa22.53■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 PRKACGP22612 351 aa22.53■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC6A8P48029 635 aa22.53■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 PLAURQ03405 335 aa22.53■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 MERTKQ12866 999 aa22.53■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 CHAF1BQ13112 559 aa22.53■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 LAPTM4AQ15012 233 aa22.53■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 OPN5Q6U736 354 aa22.53■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 LSMEM1Q8N8F7 131 aa22.53■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 POGLUT1Q8NBL1 392 aa22.53■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 RASL10BQ96S79 203 aa22.53■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 KRT84Q9NSB2 600 aa22.53■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 FLRT3Q9NZU0 649 aa22.53■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa22.53■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 H0YAE9 185 aa22.53■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 NDUFB5O43674 189 aa22.53■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 COPZ1P61923 177 aa22.53■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 RPP38P78345 283 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 HOXC5Q00444 222 aa22.53■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 MED21Q13503 144 aa22.53■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 OR1Q1Q15612 314 aa22.53■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 DHRSXQ8N5I4 330 aa22.53■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC7A13Q8TCU3 470 aa22.53■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa22.53■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 FUZQ9BT04 418 aa22.53■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 LAT2Q9GZY6 243 aa22.53■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa22.53■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 MGAT4BQ9UQ53 548 aa22.53■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 POFUT2Q9Y2G5 429 aa22.53■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 PTPRBP23467 1997 aa22.52■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 SH3PXD2BA1X283 911 aa22.52■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 DLGAP1O14490 977 aa22.52■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 FADS1O60427 444 aa22.52■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 ITGA10O75578 1167 aa22.52■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 PRG2P13727 222 aa22.52■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 HTR2AP28223 471 aa22.52■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 DAPP51397 102 aa22.52■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 NTRK2Q16620 822 aa22.52■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 GDF7Q7Z4P5 450 aa22.52■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 TFAP2CQ92754 450 aa22.52■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 HGDQ93099 445 aa22.52■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 FEVQ99581 238 aa22.52■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 CTPS2Q9NRF8 586 aa22.52■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 SELENONQ9NZV5 590 aa22.52■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
ECHDC3-201ENST00000379215 TP53I11O14683 189 aa22.51■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 OR10H3O60404 316 aa22.51■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 ADAP00813 363 aa22.51■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 SKP2Q13309 424 aa22.51■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 CAMK2BQ13554 666 aa22.51■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 CD226Q15762 336 aa22.51■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 TTC23Q5W5X9 447 aa22.51■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 LYPD8Q6UX82 237 aa22.51■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 RRM2BQ7LG56 351 aa22.51■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa22.51■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa22.51■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 SNAP29O95721 258 aa22.5■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 CELA2AP08217 269 aa22.5■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 CAPGP40121 348 aa22.5■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 SSR4P51571 173 aa22.5■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 FBXW4P57775 412 aa22.5■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 C6orf52Q5T4I8 152 aa22.5■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 PODNL1Q6PEZ8 512 aa22.5■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 APOOLQ6UXV4 268 aa22.5■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 AQP11Q8NBQ7 271 aa22.5■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF555Q8NEP9 628 aa22.5■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 MPP4Q96JB8 637 aa22.5■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 IL17BQ9UHF5 180 aa22.5■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 CHP2O43745 196 aa22.49■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 ANGPTL1O95841 491 aa22.49■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 LINGO3P0C6S8 592 aa22.49■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 ITGAMP11215 1152 aa22.49■■□□□ 1.19
ECHDC3-201ENST00000379215 CBLP22681 906 aa22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 165.1 ms