RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 PRR13Q9NZ81 148 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 SEC14L3Q9UDX4 400 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 MYO7AQ13402 2215 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1B0GTQ1 180 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 EPOPA6NHQ4 379 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 WWP2O00308 870 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 CTDSPLO15194 276 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 YY2O15391 372 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 SSNA1O43805 119 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 REM1O75628 298 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 TCRBP04435 133 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 C1SP09871 688 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 VSIG8P0DPA2 414 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 PRKACAP17612 351 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 SLC1A3P43003 542 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 AVPR1BP47901 424 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 KCNJ5P48544 419 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 TPMTP51580 245 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 SGSHP51688 502 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 CLCNKAP51800 687 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 RPS7P62081 194 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 DHODHQ02127 395 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 PUDPQ08623 228 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 NFE2L1Q14494 772 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 PDGFRLQ15198 375 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 METTL11BQ5VVY1 283 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 TCTN3Q6NUS6 607 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 BHLHB9Q6PI77 547 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 FAM198BQ6UWH4 519 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 CEACAM20Q6UY09 585 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 RASGRP3Q8IV61 690 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 GID4Q8IVV7 300 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 TIGD4Q8IY51 512 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 C15orf40Q8WUR7 153 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 PTP4A1Q93096 173 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 EID2BQ96D98 161 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 WDR34Q96EX3 536 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 COQ10AQ96MF6 247 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 NECTIN4Q96NY8 510 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 TAAR9Q96RI9 348 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 PKP4Q99569 1192 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 FUZQ9BT04 418 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 IFT27Q9BW83 186 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 B3GNT4Q9C0J1 378 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 CLDND1Q9NY35 253 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 CCL26Q9Y258 94 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF175Q9Y473 711 aa6.71□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 DOCK6Q96HP0 2047 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 TRANK1O15050 2925 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 LRRN3E7EW58 273 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 LRRTM2O43300 516 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 NDUFA2O43678 99 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 SLCO2B1O94956 709 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 SOX14O95416 240 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 CLDN7O95471 211 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 PRAMEF12O95522 483 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 SERPINA3P01011 423 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 IGHA1P01876 353 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 HMGN1P05114 100 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 SERPIND1P05546 499 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 ALPIP09923 528 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 SAGP10523 405 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 FPR2P25090 351 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 HNF1BP35680 557 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 CSKP41240 450 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 TGM4P49221 684 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 MMP15P51511 669 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 LIM2P55344 173 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 SCRN3Q0VDG4 424 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 CAMK2DQ13557 499 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 KRT33BQ14525 404 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 CDKN3Q16667 212 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 FAM71E1Q6IPT2 247 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 ADNP2Q6IQ32 1131 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 AGTRAPQ6RW13 159 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 LINGO4Q6UY18 593 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 NAXDQ8IW45 347 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 OR11H7Q8NGC8 314 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 OR2T4Q8NH00 348 aa6.71□□□□□ -1.34
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