RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 CD96P40200 585 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 TPMTP51580 245 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 CBFBQ13951 182 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SIRPB2Q5JXA9 342 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 TRILQ7L0X0 811 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 GALNT5Q7Z7M9 940 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 XAGE5Q8WWM1 108 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 HSPBAP1Q96EW2 488 aa4.64□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 ADAM7Q9H2U9 754 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa4.64□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 C1orf87Q8N0U7 546 aa4.64□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 CLSTN3Q9BQT9 956 aa4.64□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 C2orf42Q9NWW7 574 aa4.64□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 ALG1LQ6GMV1 187 aa4.64□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 GM2AP17900 193 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 HMGCLP35914 325 aa4.64□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 C21orf58P58505 322 aa4.64□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 MXD1Q05195 221 aa4.64□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SPANXCQ9NY87 97 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 UTS2RQ9UKP6 389 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 GABRQQ9UN88 632 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SLC22A14Q9Y267 594 aa4.64□□□□□ -1.67
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