RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000075430.11

CTDP1-201, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 3,538 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-201ENST00000075430 GHSRQ92847 366 aa15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 CXorf40BQ96DE9 158 aa15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 NXPE2Q96DL1 559 aa15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 AMDHD1Q96NU7 426 aa15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 FN3KQ9H479 309 aa15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 FKRPQ9H9S5 495 aa15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 TMEM138Q9NPI0 162 aa15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 KLK11Q9UBX7 282 aa15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 IL36AQ9UHA7 158 aa15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 TRPM6Q9BX84 2022 aa15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 ACOD1A6NK06 481 aa15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 TFP02787 698 aa15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 ERVFC1P60507 584 aa15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 TEKQ02763 1124 aa15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 TCEAL5Q5H9L2 206 aa15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 GARNL3Q5VVW2 1013 aa15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 FIGNL1Q6PIW4 674 aa15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 HTR3DQ70Z44 454 aa15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 SFTPA1Q8IWL2 248 aa15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 OR5M3Q8NGP4 307 aa15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 CXorf58Q96LI9 332 aa15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 COPS3Q9UNS2 423 aa15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 ALPK3Q96L96 1907 aa15.62■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 L7N2F9 121 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 BSGP35613 385 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 ST3GAL3Q11203 375 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 C1orf94Q6P1W5 598 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 NHLRC1Q6VVB1 395 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 C17orf107Q6ZR85 190 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 TIFAQ96CG3 184 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 SFXN2Q96NB2 322 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 MAB21L2Q9Y586 359 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 PDX1P52945 283 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 DEFA5Q01523 94 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 PGGHGQ32M88 737 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 ARSKQ6UWY0 536 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF547Q8IVP9 402 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 OR13C2Q8NGS9 318 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 OR6K6Q8NGW6 343 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 OR5J2Q8NH18 312 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 UBE2E3Q969T4 207 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 RGMAQ96B86 450 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 OR52D1Q9H346 318 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 A4GALTQ9NPC4 353 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 SPHK2Q9NRA0 654 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 C20orf141Q9NUB4 165 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 HS3ST2Q9Y278 367 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 RHOP08100 348 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 APEHP13798 732 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 SYN1P17600 705 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 TCTE1Q5JU00 501 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 EOGTQ5NDL2 527 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 TIGD3Q6B0B8 471 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 NUP43Q8NFH3 380 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 OR52L1Q8NGH7 329 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 ZSWIM3Q96MP5 696 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 UBQLN3Q9H347 655 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 MCCC2Q9HCC0 563 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 SPAG17Q6Q759 2223 aa15.61■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 IDSB3KWA1 339 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 LRRN3E7EW58 273 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 STK25O00506 426 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF793Q6ZN11 406 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 SPRED2Q7Z698 418 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 THAP4Q8WY91 577 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 SLC41A3Q96GZ6 507 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 RBP7Q96R05 134 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 OR14A2Q96R54 314 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 LRRN3Q9H3W5 708 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 TRIM36Q9NQ86 728 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 RAD1O60671 282 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 SLC19A2O60779 497 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 SPDEFO95238 335 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 RASGRP1O95267 797 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 FAM157BP0CG42 384 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 NDUFV2P19404 249 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 RAB3BP20337 219 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 GSTM3P21266 225 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 GAS1P54826 345 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms