RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpr31F8VQN3 319 aa15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr519K7N645 319 aa15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r102L7N279 857 aa15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ifi203O35368 408 aa15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PdynO35417 248 aa15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lsm2O35900 95 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nthl1O35980 300 aa15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sbk2P0C5K1 362 aa15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 VegfbP49766 207 aa15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ranbp3lQ6PDH4 491 aa15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mrps7Q80X85 242 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Eri3Q8C460 337 aa15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem163Q8C996 288 aa15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ston1Q8CDJ8 730 aa15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdkl1Q8CEQ0 352 aa15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q91W34 466 aa15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Krt88Q9CPR6 171 aa15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 5330417H12RikQ9D3P2 110 aa15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr705Q9EPF7 316 aa15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Acox3Q9EPL9 700 aa15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp68Q9Z116 606 aa15.08■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem156A0A1D5RLR8 321 aa15.07■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Stxbp1O08599 594 aa15.07■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccrl2O35457 360 aa15.07■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rasd1O35626 280 aa15.07■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Grxcr1Q50H32 290 aa15.07■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 EngQ63961 653 aa15.07■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc6a7Q6PGE7 637 aa15.07■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lrrc75bQ7TPD7 306 aa15.07■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tor2aQ8R1J9 321 aa15.07■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 RhouQ9EQT3 261 aa15.07■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 S100a2J3QMC7 104 aa15.07■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc6a12P31651 614 aa15.07■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 C1qaP98086 245 aa15.07■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 RflnbQ5SVD0 216 aa15.07■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rad51ap1Q8C551 337 aa15.07■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1491Q8VEZ5 319 aa15.07■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr700Q8VFM5 316 aa15.07■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MsraQ9D6Y7 233 aa15.07■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ak4Q9WUR9 223 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc9a6A1L3P4 702 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Spaca5A2AE20 160 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nlgn4lB0F2B4 945 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ssxa1B1AUS7 101 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp141G3UY09 685 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr629Q0VBH3 314 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ffar3Q3UFD7 319 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rbm38Q62176 237 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr598Q7TRR2 319 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Otop2Q80SX5 563 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sgpp2Q810K3 354 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tgif2Q8C0Y1 237 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mmp28Q8CGV8 520 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdrt4Q9DA64 179 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fank1Q9DAM9 344 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Aldh7a1Q9DBF1 539 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nrip3Q9JJR9 240 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tp53bp1P70399 1969 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adamts9E9PUN6 1931 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 P01648 108 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc1a3P56564 543 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Col19a1Q0VF58 1136 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arntl2Q2VPD4 579 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Klhl21Q3U410 597 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fzd3Q61086 666 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ShbQ6PD21 503 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp866Q6PGD2 520 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Acsm4Q80W40 580 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trmt61aQ80XC2 290 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ugt2a3Q8BWQ1 534 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rae1Q8C570 368 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdc73Q8JZM7 531 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 UqcrbQ9D855 111 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dclk1Q9JLM8 756 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kcnj10Q9JM63 379 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Asb3Q9WV72 525 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Eml5Q8BQM8 1977 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ckap5A2AGT5 2032 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ajap1A2ALI5 412 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 P04214 136 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gabra3P26049 492 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcbp3P57722 371 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CpeQ00493 476 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mtf1Q07243 675 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam187bQ0VAY3 358 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 E330014E10RikQ3UL33 481 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccdc190Q3URK1 288 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 D5Ertd577eQ499F0 481 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tha1Q6XPS7 400 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Neu4Q8BZL1 478 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Colec12Q8K4Q8 742 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr633Q8VF02 312 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q9CQF4 240 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam3bQ9D309 235 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Med11Q9D8C6 117 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trim3Q9R1R2 744 aa15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ilf3Q9Z1X4 898 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rpl7a-ps5A0A140T8L3 268 aa15.05■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Timp2P25785 220 aa15.05■□□□□ 0
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cnr2P47936 347 aa15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43.4 ms