RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601392.5

CELF4-222, Transcript of CUGBP Elav-like family member 4, human

TSL 1 (best)

Gene CELF4, Length 989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CELF4-222	ENST00000601392	WLS	Q5T9L3	541 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	OPN5	Q6U736	354 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	GALNT10	Q86SR1	603 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	SLC5A8	Q8N695	610 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	SMYD1	Q8NB12	490 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	OR4C3	Q8NH37	302 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	RNF138	Q8WVD3	245 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	TMCO6	Q96DC7	493 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	OMA1	Q96E52	524 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	TPD52L3	Q96J77	140 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	ARHGDIG	Q99819	225 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	BDH2	Q9BUT1	245 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	CDHR4	A6H8M9	788 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	ALG1L2	C9J202	215 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	CLOCK	O15516	846 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	FMO6P	O60774	539 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	EPPIN	O95925	133 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	IFNW1	P05000	195 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	FBXO45	P0C2W1	286 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	RHCE	P18577	417 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	IL12B	P29460	328 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	HMGA2	P52926	109 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	MLF1	P58340	268 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	KLRB1	Q12918	225 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	ATP1A4	Q13733	1029 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	FGFBP1	Q14512	234 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	ATP6AP1	Q15904	470 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	MAPK14	Q16539	360 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	NRF1	Q16656	503 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	LYPD8	Q6UX82	237 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	ZAR1	Q86SH2	424 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	VRK2	Q86Y07	508 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	TEX19	Q8NA77	164 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	RASL10B	Q96S79	203 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	ADO	Q96SZ5	270 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	LRRC42	Q9Y546	428 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	SCN2A	Q99250	2005 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	SERINC4	A6NH21	518 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392		A6NL46	340 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392		H3BNH8	94 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	WWP2	O00308	870 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	SCD	O00767	359 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	PEX1	O43933	1283 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	FADS1	O60427	444 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	TIPRL	O75663	272 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	OR2J2	O76002	312 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	UTS2	O95399	124 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	CST1	P01037	141 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	LDLR	P01130	860 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	ITGAM	P11215	1152 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	CYP4B1	P13584	511 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	HPGD	P15428	266 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	CASR	P41180	1078 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	SMIM11A	P58511	58 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	VLDLR	P98155	873 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	TLE1	Q04724	770 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392		Q0VFX4	171 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	SNTA1	Q13424	505 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	NNAT	Q16517	81 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	NTRK2	Q16620	822 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	MEP1A	Q16819	746 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	CARM1	Q86X55	608 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	MISP	Q8IVT2	679 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	LILRA2	Q8N149	483 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	PSMF1	Q92530	271 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	HGD	Q93099	445 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
CELF4-222	ENST00000601392	NRBF2	Q96F24	287 aa		11.71	□□□□□ -0.53

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