RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583704.1

TTC19-210, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 19, humanhuman

TSL 2

Gene TTC19, Length 552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19-210ENST00000583704 NEUROD4Q9HD90 331 aa20.1■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 RAP2CQ9Y3L5 183 aa20.1■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 SNX8Q9Y5X2 465 aa20.1■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 LINC01387J3KSC0 135 aa20.09■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 SIAH2O43255 324 aa20.09■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 FOSL1P15407 271 aa20.09■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 PRPS1L1P21108 318 aa20.09■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 BGNP21810 368 aa20.09■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 SLC1A6P48664 564 aa20.09■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 PRIM2P49643 509 aa20.09■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 MPP2Q14168 576 aa20.09■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa20.09■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 NUDT8Q8WV74 236 aa20.09■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 CHMP6Q96FZ7 201 aa20.09■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 C20orf27Q9GZN8 174 aa20.09■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 ZNF175Q9Y473 711 aa20.09■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa20.08■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 ALOX5P09917 674 aa20.08■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 G6PDP11413 515 aa20.08■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 POU2F1P14859 743 aa20.08■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 HOXC12P31275 282 aa20.08■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 EMX2Q04743 252 aa20.08■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 C17orf67Q0P5P2 114 aa20.08■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 DUSP5Q16690 384 aa20.08■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 FIGNL1Q6PIW4 674 aa20.08■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa20.08■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 NATD1Q8N6N6 113 aa20.08■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 METTL25Q8N6Q8 603 aa20.08■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 COX18Q8N8Q8 333 aa20.08■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 OR5P2Q8WZ92 322 aa20.08■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 MED18Q9BUE0 208 aa20.08■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 VDAC3Q9Y277 283 aa20.08■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 AP4B1Q9Y6B7 739 aa20.08■□□□□ 0.81
TTC19-210ENST00000583704 NAV3Q8IVL0 2385 aa20.08■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 DEFB108AA8MXU0 73 aa20.07■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 KCNK2O95069 426 aa20.07■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 C6orf47O95873 294 aa20.07■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 CGAP01215 116 aa20.07■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 UGT2B10P36537 528 aa20.07■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 KCNJ5P48544 419 aa20.07■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 PCYT1AP49585 367 aa20.07■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 RPL14P50914 215 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 STX3Q13277 289 aa20.07■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 TMEM44Q2T9K0 475 aa20.07■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 GGNQ86UU5 652 aa20.07■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 RIMKLAQ8IXN7 391 aa20.07■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 ANKRD42Q8N9B4 389 aa20.07■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 COQ8BQ96D53 544 aa20.07■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 SORT1Q99523 831 aa20.07■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 ZNF226Q9NYT6 803 aa20.07■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 CFLARO15519 480 aa20.06■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 AQP8O94778 261 aa20.06■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 CD8BP10966 210 aa20.06■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 CCT3P49368 545 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 TP53BP2Q13625 1128 aa20.06■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 SGCBQ16585 318 aa20.06■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 SMU1Q2TAY7 513 aa20.06■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 SPDYE7PQ495Y7 208 aa20.06■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 HHATQ5VTY9 493 aa20.06■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 PPP4R4Q6NUP7 873 aa20.06■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 ZNF550Q7Z398 422 aa20.06■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 KIRREL3Q8IZU9 778 aa20.06■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 ZNF610Q8N9Z0 462 aa20.06■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 FAM110BQ8TC76 370 aa20.06■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 PIK3IP1Q96FE7 263 aa20.06■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 SLC39A3Q9BRY0 314 aa20.06■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 DUSP26Q9BV47 211 aa20.06■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 CXorf36Q9H7Y0 433 aa20.06■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 AKTIPQ9H8T0 292 aa20.06■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 ASIC5Q9NY37 505 aa20.06■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 ELOVL5Q9NYP7 299 aa20.06■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 ALG1L2C9J202 215 aa20.05■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 NDUFB5O43674 189 aa20.05■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 ERLIN1O75477 346 aa20.05■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 CRYGSP22914 178 aa20.05■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 CLDN8P56748 225 aa20.05■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 FGFBP1Q14512 234 aa20.05■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 GUSBP1Q15486 140 aa20.05■□□□□ 0.8
TTC19-210ENST00000583704 PGS1Q32NB8 556 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.6 ms