RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, human

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRIM25-208	ENST00000574234	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF525	Q8N782	197 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	BANP	Q8N9N5	519 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	SMPDL3A	Q92484	453 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	NCLN	Q969V3	563 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PGM2	Q96G03	612 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	GNRHR2	Q96P88	292 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PANX2	Q96RD6	677 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PROK2	Q9HC23	129 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ARL15	Q9NXU5	204 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CNIH4	Q9P003	139 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	UPB1	Q9UBR1	384 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	HAO1	Q9UJM8	370 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PLCE1	Q9P212	2302 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF487	B1APH4	448 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	AP4M1	O00189	453 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	NDUFS8	O00217	210 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	HAT1	O14929	419 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	FMO6P	O60774	539 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	AVIL	O75366	819 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	TGFA	P01135	160 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CGA	P01215	116 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	IGHA1	P01876	353 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	MED14OS	P0DP75	135 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	GZMA	P12544	262 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	STMN1	P16949	149 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	TBXA2R	P21731	343 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PCMT1	P22061	227 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	HRH2	P25021	359 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PTAFR	P25105	342 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	DPP4	P27487	766 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	GSTM2	P28161	218 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CCR7	P32248	378 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	DIO1	P49895	249 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ALDH3A2	P51648	485 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PSG6	Q00889	435 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	LGALS3BP	Q08380	585 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CAMK2D	Q13557	499 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	FGFBP1	Q14512	234 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	AADACL2	Q6P093	401 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	VWA1	Q6PCB0	445 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234		Q6ZRM9	215 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	GPSM1	Q86YR5	675 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	IPMK	Q8NFU5	416 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF597	Q96LX8	424 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	RNF157	Q96PX1	679 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	SNX18	Q96RF0	628 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	KRT12	Q99456	494 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	CARD6	Q9BX69	1037 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	SLITRK2	Q9H156	845 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	SNX15	Q9NRS6	342 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TRIM25-208	ENST00000574234	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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