RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATP1A4Q13733 1029 aa15.85■□□□□ 0.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF605Q86T29 641 aa15.85■□□□□ 0.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 PACRGLQ8N7B6 248 aa15.85■□□□□ 0.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 GATSQ8NAP1 163 aa15.85■□□□□ 0.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR5M3Q8NGP4 307 aa15.85■□□□□ 0.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 KCNE4Q8WWG9 221 aa15.85■□□□□ 0.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 C8orf4Q9NR00 106 aa15.85■□□□□ 0.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 A4GNTQ9UNA3 340 aa15.85■□□□□ 0.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 SERINC4A6NH21 518 aa15.84■□□□□ 0.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 SEMA7AO75326 666 aa15.84■□□□□ 0.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 H1F0P07305 194 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 LCN1P31025 176 aa15.84■□□□□ 0.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 TAF11Q15544 211 aa15.84■□□□□ 0.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa15.84■□□□□ 0.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 FGD3Q5JSP0 725 aa15.84■□□□□ 0.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 COLEC12Q5KU26 742 aa15.84■□□□□ 0.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 ENTPD8Q5MY95 495 aa15.84■□□□□ 0.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa15.84■□□□□ 0.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF248Q8NDW4 579 aa15.84■□□□□ 0.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC22A8Q8TCC7 542 aa15.84■□□□□ 0.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa15.84■□□□□ 0.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRRC1Q96M27 445 aa15.84■□□□□ 0.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 SMURF2Q9HAU4 748 aa15.84■□□□□ 0.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 ACER3Q9NUN7 267 aa15.84■□□□□ 0.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 C15orf41Q9Y2V0 281 aa15.84■□□□□ 0.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 DCHS1Q96JQ0 3298 aa15.84■□□□□ 0.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 UGT2B11O75310 529 aa15.83■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPM1BO75688 479 aa15.83■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR2J2O76002 312 aa15.83■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 TBXA2RP21731 343 aa15.83■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 SMIM11AP58511 58 aa15.83■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 DAG1Q14118 895 aa15.83■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZSWIM7Q19AV6 140 aa15.83■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 KLHL26Q53HC5 615 aa15.83■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 CMIPQ8IY22 773 aa15.83■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 NRBF2Q96F24 287 aa15.83■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 ALPK1Q96QP1 1244 aa15.83■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIF17Q9P2E2 1029 aa15.83■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMCC3Q9ULS5 477 aa15.83■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 NTNG1Q9Y2I2 539 aa15.83■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR6C70A6NIJ9 312 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 H3BNH8 94 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADRB1P08588 477 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRG2P13727 222 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 ALDH3A2P51648 485 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 GIPC3Q8TF64 312 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 EVA1AQ9H8M9 152 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 ACAD8Q9UKU7 415 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 LRRC42Q9Y546 428 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 C7orf72A4D263 438 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 NADKO95544 446 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 ITGAMP11215 1152 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 FUT4P22083 530 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMED10P49755 219 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF136P52737 540 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 FBXW4P57775 412 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 IL1RL1Q01638 556 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 EFR3AQ14156 821 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 MICAQ29983 383 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 NDUFAF6Q330K2 333 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 DCST1Q5T197 706 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 ANKRD34AQ69YU3 496 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 FCRLBQ6BAA4 426 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF550Q7Z398 422 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATG16L2Q8NAA4 619 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 PIK3C3Q8NEB9 887 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR4C15Q8NGM1 316 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 RNF217Q8TC41 542 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 OIT3Q8WWZ8 545 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 NR4A3Q92570 626 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARSGQ96EG1 525 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 OSBPL10Q9BXB5 764 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 CDCP1Q9H5V8 836 aa15.82■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 H0YJX3 145 aa15.81■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 ITGA10O75578 1167 aa15.81■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCNB2O95067 398 aa15.81■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 SERPINA7P05543 415 aa15.81■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 UBL4AP11441 157 aa15.81■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 RYKP34925 604 aa15.81■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 HSPA13P48723 471 aa15.81■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 HMGA2P52926 109 aa15.81■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 ST3GAL3Q11203 375 aa15.81■□□□□ 0.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 DCAF10Q5QP82 559 aa15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms