RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556355.5

SRP54-AS1-203, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SRP54-AS1, Length 603 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SSR1P43307 286 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 HSPA2P54652 639 aa3.56□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ZNF33BQ06732 778 aa3.56□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 FCHO2Q0JRZ9 810 aa3.56□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TPSAB1Q15661 275 aa3.56□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CCL14Q16627 93 aa3.56□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PCK2Q16822 640 aa3.56□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SNAI3Q3KNW1 292 aa3.56□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 C10orf120Q5SQS8 335 aa3.56□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SEL1L2Q5TEA6 688 aa3.56□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 FAM71F2Q6NXP2 309 aa3.56□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CYS1Q717R9 158 aa3.56□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa3.56□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SLC38A6Q8IZM9 456 aa3.56□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 BPIFB2Q8N4F0 458 aa3.56□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ZNF491Q8N8L2 437 aa3.56□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 OR10A7Q8NGE5 316 aa3.56□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CNIH3Q8TBE1 160 aa3.56□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 NTNG2Q96CW9 530 aa3.56□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TPD52L3Q96J77 140 aa3.56□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ZNF597Q96LX8 424 aa3.56□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PLIN2Q99541 437 aa3.56□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TMEM121Q9BTD3 319 aa3.56□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ANP32EQ9BTT0 268 aa3.56□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TMEM43Q9BTV4 400 aa3.56□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 EDEM2Q9BV94 578 aa3.56□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PKIBQ9C010 78 aa3.56□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PANK3Q9H999 370 aa3.56□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 FN3KRPQ9HA64 309 aa3.56□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CTSZQ9UBR2 303 aa3.56□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ASIC3Q9UHC3 531 aa3.56□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 IQGAP2Q13576 1575 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 DISP1Q96F81 1524 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 USP6P35125 1406 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 A0A1B0GTH9 108 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 OR7A17O14581 309 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 LRATO95237 230 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 WNT2P09544 360 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 H2BFMP0C1H6 154 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RPL4P36578 427 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 GRIA1P42261 906 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 POU3F4P49335 361 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TAF6P49848 677 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CYP51A1Q16850 503 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TMEM44Q2T9K0 475 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 KRT71Q3SY84 523 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 C9orf66Q5T8R8 295 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 LGSNQ5TDP6 509 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ZNF613Q6PF04 617 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 KCNIP4Q6PIL6 250 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 STAC2Q6ZMT1 411 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 NLRP9Q7RTR0 991 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CCDC50Q8IVM0 306 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 VSTM4Q8IW00 320 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 FAM3CQ92520 227 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PIGCQ92535 297 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 FBXO32Q969P5 355 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 COQ2Q96H96 371 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 AMDHD1Q96NU7 426 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 NPAS2Q99743 824 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SLC6A7Q99884 636 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 LRRC61Q9BV99 259 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 GFRA4Q9GZZ7 299 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 NMRK1Q9NWW6 199 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 HYPKQ9NX55 129 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CDH9Q9ULB4 789 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RNF24Q9Y225 148 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 NTNG1Q9Y2I2 539 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ALG6Q9Y672 507 aa3.55□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PLB1Q6P1J6 1458 aa3.54□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PNPLA6Q8IY17 1366 aa3.54□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TNIKQ9UKE5 1360 aa3.54□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 FRMPD4Q14CM0 1322 aa3.54□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 BCORL1Q5H9F3 1711 aa3.54□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 NDUFAF8A1L188 74 aa3.54□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 XKRY2A2RUG3 117 aa3.54□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa3.54□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RPL37AP8A6NKH3 93 aa3.54□□□□□ -1.84
SRP54-AS1-203ENST00000556355 MSH4O15457 936 aa3.54□□□□□ -1.84
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