RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 MARCH3Q86UD3 253 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 C9orf106Q8NAJ2 232 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 OR4C3Q8NH37 302 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 SFXN5Q8TD22 340 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 PIK3R3Q92569 461 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 MOAP1Q96BY2 351 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 TUBGCP3Q96CW5 907 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 SORT1Q99523 831 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 SFXN3Q9BWM7 321 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 BTBD2Q9BX70 525 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 C20orf27Q9GZN8 174 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 PIGUQ9H490 435 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 EQTNQ9NQ60 294 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 UBQLN4Q9NRR5 601 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 MED11Q9P086 117 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 A0A087WZY1 265 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 C7orf72A4D263 438 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 SH3D21A4FU49 640 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 C17orf51A8MQB3 221 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 H7C1Q1 480 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 KRT16P08779 473 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 G6PDP11413 515 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 HK1P19367 917 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 PCSK6P29122 969 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 SLC1A6P48664 564 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 CCT3P49368 545 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 PRKAG1P54619 331 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 CLDN15P56746 228 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 POU4F3Q15319 338 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 AP1ARQ63HQ0 302 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 CDC73Q6P1J9 531 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 P3H2Q8IVL5 708 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 MISPQ8IVT2 679 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 ZNF781Q8N8C0 355 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 OR8J2Q8NGG1 315 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 OR56A1Q8NGH5 318 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 ACTRT2Q8TDY3 377 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 SLC9A6Q92581 669 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 PIGTQ969N2 578 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 C16orf58Q96GQ5 468 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 PKNOX2Q96KN3 472 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 PIGQQ9BRB3 760 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 BDH2Q9BUT1 245 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 C1orf50Q9BV19 199 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 ACTRT3Q9BYD9 372 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 CXorf36Q9H7Y0 433 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 AKTIPQ9H8T0 292 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 GPATCH2Q9NW75 528 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 AP4B1Q9Y6B7 739 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 OR2M5A3KFT3 312 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 WDR91A4D1P6 747 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 ANKRD28O15084 1053 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 NDUFB5O43674 189 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 SMPD2O60906 423 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 TNFRSF21O75509 655 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 ZNF17P17021 662 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 SRYQ05066 204 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 FOXF2Q12947 444 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 OR2A2Q6IF42 318 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 OGFOD2Q6N063 350 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 BHLHB9Q6PI77 547 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 COX18Q8N8Q8 333 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 Q96MF0 132 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 DUSP26Q9BV47 211 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 HOXD1Q9GZZ0 328 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 PIGMQ9H3S5 423 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 FBXO34Q9NWN3 711 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 GALNT8Q9NY28 637 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 ADAM21Q9UKJ8 722 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 ZNF337Q9Y3M9 751 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 ZNF175Q9Y473 711 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 INAFM1C9JVW0 142 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 NPIPB9F8W1W9 429 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 SCN2BO60939 215 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 TNFSF13O75888 250 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 C6orf47O95873 294 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 TGM6O95932 706 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 GUSBP08236 651 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
CS-221ENST00000550734 RFX3P48380 749 aa10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms