RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520348.5

SNHG6-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 6, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG6, Length 648 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG6-201ENST00000520348 C9orf172C9J069 976 aa14.77□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 BCKDKO14874 412 aa14.77□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 PLD2O14939 933 aa14.77□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 GASTP01350 101 aa14.77□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 PRG2P13727 222 aa14.77□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 TBXA2RP21731 343 aa14.77□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 IFNA8P32881 189 aa14.77□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 PNLIPRP2P54317 469 aa14.77□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 ISL1P61371 349 aa14.77□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 APOFQ13790 326 aa14.77□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 PCOLCEQ15113 449 aa14.77□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa14.77□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 FAAH2Q6GMR7 532 aa14.77□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 ZNF613Q6PF04 617 aa14.77□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 ZNF550Q7Z398 422 aa14.77□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 GDF7Q7Z4P5 450 aa14.77□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 GALNT5Q7Z7M9 940 aa14.77□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 LSMEM1Q8N8F7 131 aa14.77□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 OR4K5Q8NGD3 323 aa14.77□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 RNF138Q8WVD3 245 aa14.77□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 SLC38A4Q969I6 547 aa14.77□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 SLC41A3Q96GZ6 507 aa14.77□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 PRSS27Q9BQR3 290 aa14.77□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 ZNF559Q9BR84 538 aa14.77□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 PRR14Q9BWN1 585 aa14.77□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 FAM117AQ9C073 453 aa14.77□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 BATF3Q9NR55 127 aa14.77□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 REV1Q9UBZ9 1251 aa14.77□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 VPS13AQ96RL7 3174 aa14.77□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 TMEM200CA6NKL6 621 aa14.76□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 TRIM64CA6NLI5 447 aa14.76□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 ADAM10O14672 748 aa14.76□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 KLF4O43474 513 aa14.76□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 UTS2O95399 124 aa14.76□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 NADKO95544 446 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 IGHEP01854 428 aa14.76□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 TP53P04637 393 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 EPHA2P29317 976 aa14.76□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 UGT2B15P54855 530 aa14.76□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 CLDN6P56747 220 aa14.76□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 ESRRGP62508 458 aa14.76□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 COX10Q12887 443 aa14.76□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 HES3Q5TGS1 186 aa14.76□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 KLHL17Q6TDP4 642 aa14.76□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 DHRS13Q6UX07 377 aa14.76□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 HSDL2Q6YN16 418 aa14.76□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 ZER1Q7Z7L7 766 aa14.76□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 ZNF440Q8IYI8 595 aa14.76□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 SETD9Q8NE22 299 aa14.76□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 IMMP1LQ96LU5 166 aa14.76□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 GAL3ST4Q96RP7 486 aa14.76□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 ZNF426Q9BUY5 554 aa14.76□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 ZNF700Q9H0M5 742 aa14.76□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 RIBC2Q9H4K1 309 aa14.76□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 ZNF556Q9HAH1 456 aa14.76□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 PISDQ9UG56 409 aa14.76□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 SCOCQ9UIL1 159 aa14.76□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 NTNG1Q9Y2I2 539 aa14.76□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 A0A0B4J2E0 115 aa14.75□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa14.75□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 A0A1B0GX12 115 aa14.75□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 OR6C70A6NIJ9 312 aa14.75□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 PROB1E7EW31 1015 aa14.75□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 OR10H3O60404 316 aa14.75□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 ABCB7O75027 752 aa14.75□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 ADAM11O75078 769 aa14.75□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 JMJD7P0C870 316 aa14.75□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 CYP4B1P13584 511 aa14.75□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 NAGAP17050 411 aa14.75□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 ABCD3P28288 659 aa14.75□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 RFX3P48380 749 aa14.75□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 GSSP48637 474 aa14.75□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 NUP107P57740 925 aa14.75□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 HOXC5Q00444 222 aa14.75□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 PLCXD2Q0VAA5 305 aa14.75□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 RAPSNQ13702 412 aa14.75□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 OR1Q1Q15612 314 aa14.75□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 LAIR2Q6ISS4 152 aa14.75□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 ZNF527Q8NB42 609 aa14.75□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 ELP5Q8TE02 316 aa14.75□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 OMA1Q96E52 524 aa14.75□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 UCK2Q9BZX2 261 aa14.75□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 TRIM2Q9C040 744 aa14.75□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 NRSN2Q9GZP1 204 aa14.75□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SNHG6-201ENST00000520348 FLRT3Q9NZU0 649 aa14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.9 ms