RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 C16orf58Q96GQ5 468 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 STACQ99469 402 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 BTBD2Q9BX70 525 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 GLRX2Q9NS18 164 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 ITPR3Q14573 2671 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 H3BNH8 94 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 PEX11AO75192 247 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 AQP8O94778 261 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 SOX30O94993 753 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 CGAP01215 116 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 KRT16P08779 473 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 RAC1P63000 192 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 CCNJQ5T5M9 372 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 BIVMQ86UB2 503 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 BANPQ8N9N5 519 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 ADAMTS15Q8TE58 950 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 POM121Q96HA1 1249 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 RNF145Q96MT1 663 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 HOXD1Q9GZZ0 328 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 MED17Q9NVC6 651 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 ATP6V1HQ9UI12 483 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 ABCA4P78363 2273 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 A0A1W2PQD3 144 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 TMEM233B4DJY2 109 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 TNFSF11O14788 317 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 CFLARO15519 480 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 SPAG7O75391 227 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 OPN1LWP04000 364 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 PPP3CBP16298 524 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 HOXC12P31275 282 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 SERPINB5P36952 375 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 EIF1P41567 113 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 PLPPR5Q32ZL2 321 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 ANKRD34AQ69YU3 496 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 HBMQ6B0K9 141 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 TRABD2AQ86V40 505 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 FNDC5Q8NAU1 212 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 OR7A2PQ8NGA2 310 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 OR56A1Q8NGH5 318 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 OR2W6PQ8NHA6 318 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 CDS1Q92903 461 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 CAVIN3Q969G5 261 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 C18orf12Q96KH6 178 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 CCL19Q99731 98 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 PIP5K1AQ99755 562 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 MECRQ9BV79 373 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 PIGUQ9H490 435 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 TIGARQ9NQ88 270 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 DUSP22Q9NRW4 184 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 CLEC4AQ9UMR7 237 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 A0A1W2PPR1 153 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 C7orf72A4D263 438 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 DEFB108AA8MXU0 73 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 CXCL13O43927 109 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 SLU7O95391 586 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 SLC6A8P48029 635 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 CCT3P49368 545 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 TP53BP2Q13625 1128 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 ACKR1Q16570 336 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 CDC73Q6P1J9 531 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 BEND4Q6ZU67 534 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 OR2V1Q8NHB1 315 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 TCP10LQ8TDR4 215 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 OR5P2Q8WZ92 322 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 ACTRT3Q9BYD9 372 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 TMEM185BQ9H7F4 350 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 DLL4Q9NR61 685 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 GIN1Q9NXP7 522 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 SLC17A7Q9P2U7 560 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 GJE1A6NN92 205 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 CCKARP32238 428 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 CARD18P57730 90 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 GUSBP1Q15486 140 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 UGT3A2Q3SY77 523 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 BHLHB9Q6PI77 547 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 C20orf204Q6ZNR8 217 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 ZAR1Q86SH2 424 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 LILRA2Q8N149 483 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-212ENST00000484841 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms