RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 TUBA1CQ9BQE3 449 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 NLNQ9BYT8 704 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 LRRCC1Q9C099 1032 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 VIPAS39Q9H9C1 493 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 CHMP5Q9NZZ3 219 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 ERVK-18Q9QC07 812 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 MIOXQ9UGB7 285 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 BCAP29Q9UHQ4 241 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 ADAM28Q9UKQ2 775 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 MMP17Q9ULZ9 603 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 B9D1Q9UPM9 204 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 NEDD4P46934 1319 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 TLN2Q9Y4G6 2542 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 MYH10P35580 1976 aa4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A087WZ39 114 aa4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A1W2PS18 150 aa4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 LMO7DNF2Z398 122 aa4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 LRCH4O75427 683 aa4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 MFN2O95140 757 aa4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 TOP1P11387 765 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 DAOP14920 347 aa4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 CTNNA2P26232 953 aa4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 HTR2AP28223 471 aa4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 MATKP42679 507 aa4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 DCDC1P59894 354 aa4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 ERVPABLB-1P60509 514 aa4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 HERV-K104P61576 105 aa4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 NAAAQ02083 359 aa4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 NME3Q13232 169 aa4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 NFATC2Q13469 925 aa4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 C3AR1Q16581 482 aa4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 TECRLQ5HYJ1 363 aa4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 NIPAL3Q6P499 406 aa4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 FCRLAQ7L513 359 aa4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 ISCA2Q86U28 154 aa4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 ITIH5Q86UX2 942 aa4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 CDH26Q8IXH8 852 aa4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 METTL13Q8N6R0 699 aa4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM37Q8WXS4 190 aa4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 TCEANC2Q96MN5 208 aa4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 LPAR4Q99677 370 aa4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 P2RY13Q9BPV8 354 aa4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 NDUFAF3Q9BU61 184 aa4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 VCX2Q9H322 139 aa4.86□□□□□ -1.63
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STRADBP1-201ENST00000478954 AZI2Q9H6S1 392 aa4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 LRRC40Q9H9A6 602 aa4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 ASCL3Q9NQ33 180 aa4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 ECHDC1Q9NTX5 307 aa4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 COL1A2P08123 1366 aa4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 CROCCQ5TZA2 2017 aa4.85□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa4.85□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 CD8B2A6NJW9 211 aa4.85□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 PRAC2D3DTV9 90 aa4.85□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 EPHB6O15197 1021 aa4.85□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 KLHL41O60662 606 aa4.85□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 KRT33AO76009 404 aa4.85□□□□□ -1.63
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STRADBP1-201ENST00000478954 NGFP01138 241 aa4.85□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 UGT2B4P06133 528 aa4.85□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 GP9P14770 177 aa4.85□□□□□ -1.63
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STRADBP1-201ENST00000478954 NUCB2P80303 420 aa4.85□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 TNFRSF17Q02223 184 aa4.85□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 RUNX3Q13761 415 aa4.85□□□□□ -1.63
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STRADBP1-201ENST00000478954 OR56B2PQ8NGI1 322 aa4.85□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 OR13C2Q8NGS9 318 aa4.85□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 HPSE2Q8WWQ2 592 aa4.85□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 NEUROG1Q92886 237 aa4.85□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM143Q96AN5 459 aa4.85□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 ACCSQ96QU6 501 aa4.85□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 GON7Q9BXV9 100 aa4.85□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 COG4Q9H9E3 785 aa4.85□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 NMRK1Q9NWW6 199 aa4.85□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa4.85□□□□□ -1.63
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