RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463378.5

RBBP4-208, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 5

Gene RBBP4, Length 882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-208	ENST00000463378	PLA2G16	P53816	162 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	NTHL1	P78549	312 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	RAB35	Q15286	201 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	UBE2V2	Q15819	145 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	ZSCAN26	Q16670	478 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	ACOT1	Q86TX2	421 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	PARG	Q86W56	976 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	CEP112	Q8N8E3	955 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	C11orf52	Q96A22	123 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	FBXO17	Q96EF6	278 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	ESM1	Q9NQ30	184 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	AUP1	Q9Y679	476 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	CPS1	P31327	1500 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	C11orf98	E9PRG8	122 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	CIB2	O75838	187 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	OPN1LW	P04000	364 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	TMEM50B	P56557	158 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	ACTR3	P61158	418 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	GNG11	P61952	73 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	SRPX	P78539	464 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	MYL5	Q02045	173 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	CD226	Q15762	336 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	KIAA1328	Q86T90	577 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	BEST4	Q8NFU0	473 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	NANP	Q8TBE9	248 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	C8orf76	Q96K31	380 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	PKIB	Q9C010	78 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	LIME1	Q9H400	295 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	FGF22	Q9HCT0	170 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	GNG12	Q9UBI6	72 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	USP6	P35125	1406 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	AKAP12	Q02952	1782 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	C3	P01024	1663 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM74A7	A6NL05	159 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	VGLL3	A8MV65	326 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	STX10	O60499	249 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	BCKDHA	P12694	445 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	CMA1	P23946	247 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	SYK	P43405	635 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	BDH1	Q02338	343 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	CHI3L2	Q15782	390 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	SYPL1	Q16563	259 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBBP4-208	ENST00000463378	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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