RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 ALDH3A1P30838 453 aa18.82■□□□□ 0.6
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LIMS1-208ENST00000428064 KCNJ5P48544 419 aa18.82■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 FIGNL1Q6PIW4 674 aa18.82■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa18.82■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 ZAR1Q86SH2 424 aa18.82■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 GALNT10Q86SR1 603 aa18.82■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 DDIASQ8IXT1 998 aa18.82■□□□□ 0.6
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LIMS1-208ENST00000428064 COX18Q8N8Q8 333 aa18.82■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 OR10D3Q8NH80 312 aa18.82■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 PSMA8Q8TAA3 256 aa18.82■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 C18orf12Q96KH6 178 aa18.82■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 BTBD2Q9BX70 525 aa18.82■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 MED17Q9NVC6 651 aa18.82■□□□□ 0.6
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LIMS1-208ENST00000428064 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
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LIMS1-208ENST00000428064 SOX30O94993 753 aa18.81■□□□□ 0.6
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LIMS1-208ENST00000428064 FPR1P21462 350 aa18.81■□□□□ 0.6
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LIMS1-208ENST00000428064 PIK3IP1Q96FE7 263 aa18.81■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 C16orf58Q96GQ5 468 aa18.81■□□□□ 0.6
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LIMS1-208ENST00000428064 PIGUQ9H490 435 aa18.81■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
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LIMS1-208ENST00000428064 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
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LIMS1-208ENST00000428064 ELK4P28324 431 aa18.8■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 SLC6A8P48029 635 aa18.8■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 ACKR1Q16570 336 aa18.8■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 CDC73Q6P1J9 531 aa18.8■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 C20orf204Q6ZNR8 217 aa18.8■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 GATSQ8NAP1 163 aa18.8■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 OR2V1Q8NHB1 315 aa18.8■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 RNF145Q96MT1 663 aa18.8■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 NPAS1Q99742 590 aa18.8■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 ATAD3AQ9NVI7 634 aa18.8■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 FBXO34Q9NWN3 711 aa18.8■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 PLGP00747 810 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
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LIMS1-208ENST00000428064 ME2P23368 584 aa18.79■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 EIF1P41567 113 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 CD226Q15762 336 aa18.79■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa18.79■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 PDSS1Q5T2R2 415 aa18.79■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF550Q7Z398 422 aa18.79■□□□□ 0.6
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LIMS1-208ENST00000428064 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa18.79■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 POC1BQ8TC44 478 aa18.79■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 OR5P2Q8WZ92 322 aa18.79■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 JADE3Q92613 823 aa18.79■□□□□ 0.6
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LIMS1-208ENST00000428064 OR10A4Q9H209 315 aa18.79■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 FANCFQ9NPI8 374 aa18.79■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 TLDC2A0PJX2 215 aa18.78■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 SMPD2O60906 423 aa18.78■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 SYNGR4O95473 234 aa18.78■□□□□ 0.6
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LIMS1-208ENST00000428064 OR56A1Q8NGH5 318 aa18.78■□□□□ 0.6
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LIMS1-208ENST00000428064 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 ACTRT3Q9BYD9 372 aa18.78■□□□□ 0.6
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LIMS1-208ENST00000428064 SLC17A7Q9P2U7 560 aa18.78■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 ACTL7BQ9Y614 415 aa18.78■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 A0A0J9YW62 118 aa18.77■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 TNFSF11O14788 317 aa18.77■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 CXCL13O43927 109 aa18.77■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 PEX11AO75192 247 aa18.77■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 INHBBP09529 407 aa18.77■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 LAMP1P11279 417 aa18.77■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 C21orf58P58505 322 aa18.77■□□□□ 0.6
LIMS1-208ENST00000428064 PTGR1Q14914 329 aa18.77■□□□□ 0.6
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