RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409093.1

LRRTM4-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,247 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-202ENST00000409093 MINDY2Q8NBR6 621 aa9.31□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 OR52P1PQ8NH57 321 aa9.31□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP9.31□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 TXNDC15Q96J42 360 aa9.31□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 PRRC1Q96M27 445 aa9.31□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF285Q96NJ3 590 aa9.31□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 RP1P56715 2156 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 A0A1B0GWJ7 208 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 A8MUA0 341 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 LINC00587B1AMM8 73 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 E9PQ18 207 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 TPST2O60704 377 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 CLN5O75503 358 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 ADAP00813 363 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 CT62P0C5K7 136 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 GNSP15586 552 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 TTKP33981 857 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 GGT2P36268 569 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 AVPR1BP47901 424 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 IDH2P48735 452 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 ARL4DP49703 201 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 SEPHS1P49903 392 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 PIGFQ07326 219 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 STX4Q12846 297 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 RAB39AQ14964 217 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 CDK10Q15131 360 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 SYT16Q17RD7 645 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 PROX2Q3B8N5 592 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 ENTHD1Q8IYW4 607 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 VWA5B2Q8N398 1253 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 PARP8Q8N3A8 854 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 COX18Q8N8Q8 333 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 OR6C4Q8NGE1 309 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC7A13Q8TCU3 470 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 UBE2FQ969M7 185 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 CCDC90BQ9GZT6 254 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 PIGUQ9H490 435 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 CTPS2Q9NRF8 586 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 KLHL28Q9NXS3 571 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 SCN3BQ9NY72 215 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 DTX4Q9Y2E6 619 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 TPRKBQ9Y3C4 175 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 CLDN4O14493 209 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 FRS3O43559 492 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 PCDHGA12O60330 932 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 NADKO95544 446 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 CPNE6O95741 557 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 HTR1AP08908 422 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 ATXN8OSP0DMR3 200 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 GLB1P16278 677 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 TGM1P22735 817 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 PCP4P48539 62 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 UGT2B15P54855 530 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 CXCR4P61073 352 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 MGAT2Q10469 447 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 DNASE1L3Q13609 305 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 DGCR6Q14129 220 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 KCNAB1Q14722 419 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 ZMYND11Q15326 602 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 MAJINQ3KP22 176 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 DCST2Q5T1A1 773 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 KLHL17Q6TDP4 642 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 ZBTB46Q86UZ6 589 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 JAZF1Q86VZ6 243 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 PLXDC1Q8IUK5 500 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 P3H2Q8IVL5 708 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 NKAIN4Q8IVV8 208 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 GALNT12Q8IXK2 581 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF595Q8IYB9 648 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF680Q8NEM1 530 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 GRPEL2Q8TAA5 225 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 GPR151Q8TDV0 419 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 FBXW5Q969U6 566 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 CTHRC1Q96CG8 243 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 NODALQ96S42 347 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 SDF2Q99470 211 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 DUSP22Q9NRW4 184 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 MGAT4BQ9UQ53 548 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 ERVK-19Q9WJR5 959 aa9.29□□□□□ -0.92
LRRTM4-202ENST00000409093 RNF6Q9Y252 685 aa9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.2 ms