RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 SAP130Q9H0E3 1048 aa3.69□□□□□ -1.82
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LRRTM4-201ENST00000409088 IL20RAQ9UHF4 553 aa3.69□□□□□ -1.82
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LRRTM4-201ENST00000409088 CLDN16Q9Y5I7 305 aa3.69□□□□□ -1.82
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LRRTM4-201ENST00000409088 CD300LDQ6UXZ3 194 aa3.68□□□□□ -1.82
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LRRTM4-201ENST00000409088 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 GRHL3Q8TE85 626 aa3.68□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 TSLPQ969D9 159 aa3.68□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC74AQ96AQ1 378 aa3.68□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 YIPF6Q96EC8 236 aa3.68□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
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