RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376510.7

MSRB2-201, Transcript of methionine sulfoxide reductase B2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSRB2, Length 1,803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB2-201ENST00000376510 SNX5Q9Y5X3 404 aa25.28■■□□□ 1.64
MSRB2-201ENST00000376510 XPNPEP2O43895 674 aa25.27■■□□□ 1.64
MSRB2-201ENST00000376510 FAM20BO75063 409 aa25.27■■□□□ 1.64
MSRB2-201ENST00000376510 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
MSRB2-201ENST00000376510 KCTD8Q6ZWB6 473 aa25.27■■□□□ 1.64
MSRB2-201ENST00000376510 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa25.27■■□□□ 1.64
MSRB2-201ENST00000376510 OR4C3Q8NH37 302 aa25.27■■□□□ 1.64
MSRB2-201ENST00000376510 RHOXF1Q8NHV9 184 aa25.27■■□□□ 1.64
MSRB2-201ENST00000376510 OIT3Q8WWZ8 545 aa25.27■■□□□ 1.64
MSRB2-201ENST00000376510 UBQLN4Q9NRR5 601 aa25.27■■□□□ 1.64
MSRB2-201ENST00000376510 SERINC4A6NH21 518 aa25.26■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 VSTM2BA6NLU5 285 aa25.26■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 MPZL2O60487 215 aa25.26■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 CCL4P13236 92 aa25.26■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 KRT20P35900 424 aa25.26■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP25.26■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 ZNF613Q6PF04 617 aa25.26■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 C9orf40Q8IXQ3 194 aa25.26■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 TMEM255BQ8WV15 326 aa25.26■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 LMF1Q96S06 567 aa25.26■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 TRIM2Q9C040 744 aa25.26■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 CSTAP01040 98 aa25.26■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 FOXL2P58012 376 aa25.26■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 TSPAN31Q12999 210 aa25.26■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 WWTR1Q9GZV5 400 aa25.26■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 SLC26A1Q9H2B4 701 aa25.26■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa25.26■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 WBP4O75554 376 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 ZNF806P0C7X5 589 aa25.25■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 ZNF540Q8NDQ6 660 aa25.25■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 APH1BQ8WW43 257 aa25.25■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 NODALQ96S42 347 aa25.25■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 CMKLR1Q99788 373 aa25.25■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa25.25■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 C11orf16Q9NQ32 467 aa25.25■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 CCDC160A6NGH7 325 aa25.24■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 SCDO00767 359 aa25.24■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 GDF9O60383 454 aa25.24■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 OR6B1O95007 311 aa25.24■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 IL12BP29460 328 aa25.24■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 LCN1P31025 176 aa25.24■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 SLC5A2P31639 672 aa25.24■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 OMPP47874 163 aa25.24■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 PLAURQ03405 335 aa25.24■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 CASP12Q6UXS9 341 aa25.24■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 PTCHD4Q6ZW05 846 aa25.24■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 GPR141Q7Z602 305 aa25.24■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 NRMQ8IXM6 262 aa25.24■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 GPA33Q99795 319 aa25.24■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 CRB3Q9BUF7 120 aa25.24■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 CCDC90BQ9GZT6 254 aa25.24■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 SLC39A1Q9NY26 324 aa25.24■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 ZNF226Q9NYT6 803 aa25.24■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa25.23■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 REM1O75628 298 aa25.23■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 CD59P13987 128 aa25.23■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 CCKBRP32239 447 aa25.23■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 NUBP1P53384 320 aa25.23■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 TEKQ02763 1124 aa25.23■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 KLHL26Q53HC5 615 aa25.23■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 CCDC157Q569K6 752 aa25.23■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 SLX4IPQ5VYV7 408 aa25.23■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 NAXDQ8IW45 347 aa25.23■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 HSPBAP1Q96EW2 488 aa25.23■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 PRSS27Q9BQR3 290 aa25.23■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa25.23■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 UTS2O95399 124 aa25.23■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 LCN10Q6JVE6 187 aa25.23■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 ZNF440Q8IYI8 595 aa25.23■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 SPARTQ8N0X7 666 aa25.23■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 B3GNT7Q8NFL0 401 aa25.23■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 NRSN2Q9GZP1 204 aa25.23■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 CNIH4Q9P003 139 aa25.23■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa25.23■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 WDFY4Q6ZS81 3184 aa25.22■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 SAGE2PA6NJ88 616 aa25.22■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 TO15178 435 aa25.22■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 NTN1O95631 604 aa25.22■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 TP53P04637 393 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 CYC1P08574 325 aa25.22■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 ZNF28P17035 718 aa25.22■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 STAT5AP42229 794 aa25.22■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 NEDD8Q15843 81 aa25.22■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 PRR22Q8IZ63 422 aa25.22■■□□□ 1.63
MSRB2-201ENST00000376510 GRHL3Q8TE85 626 aa25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms