RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368147.8

SPTA1-201, Transcript of spectrin alpha, erythrocytic 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPTA1, Length 7,999 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Dendrite .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1-201ENST00000368147 OR7A17O14581 309 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 EI24O14681 340 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 SIGLEC6O43699 453 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 RFPL1O75677 317 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 PRKACBP22694 351 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 SOX3P41225 446 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 LANCL3Q6ZV70 420 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 CARM1Q86X55 608 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 SUMF2Q8NBJ7 301 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 GLYATL2Q8WU03 294 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 SUCNR1Q9BXA5 334 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ENKD1Q9H0I2 346 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ARNT2Q9HBZ2 717 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 TM7SF3Q9NS93 570 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 LUZP4Q9P127 313 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 STUB1Q9UNE7 303 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 PDE10AQ9Y233 779 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ACOX3O15254 700 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 TNFRSF4P43489 277 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 NPBWR1P48145 328 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 GSTM4Q03013 218 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 PTPRRQ15256 657 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 RABEPKQ7Z6M1 372 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 NLRP8Q86W28 1048 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 SLC15A3Q8IY34 581 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 DERL2Q9GZP9 239 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 DCAF16Q9NXF7 216 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 SEC14L2O76054 403 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 TMEM63AO94886 807 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 HTR3BO95264 441 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 CD3GP09693 182 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 RAP2AP10114 183 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 GMPRP36959 345 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 RAB32Q13637 225 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 AWAT2Q6E213 333 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 SLC35F3Q8IY50 421 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 BEST3Q8N1M1 668 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 OR5K1Q8NHB7 308 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 BLNKQ8WV28 456 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 UPRTQ96BW1 309 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 SPIN2AQ99865 258 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 SYT3Q9BQG1 590 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ACTRT3Q9BYD9 372 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ANKMY1Q9P2S6 941 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 CPNE7Q9UBL6 633 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 LINC01565O15544 149 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 CHRM4P08173 479 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 OR8U9P0C7N5 309 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 S1PR1P21453 382 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 SLC17A1Q14916 467 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ANKRD54Q6NXT1 300 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 PARM1Q6UWI2 310 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 KDM1BQ8NB78 822 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 GAB3Q8WWW8 586 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 HAS2Q92819 552 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 MRGPRX2Q96LB1 330 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 B3GNT2Q9NY97 397 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ST14Q9Y5Y6 855 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 CREB1P16220 341 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 GCSHP23434 173 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 PTGIRP43119 386 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 RPS5P46782 204 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 VASPP50552 380 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 ZNF181Q2M3W8 571 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 PKDCCQ504Y2 493 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 TM9SF4Q92544 642 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 MUCL1Q96DR8 90 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 SLA2Q9H6Q3 261 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 A0A0J9YY10 115 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 GXYLT2A0PJZ3 443 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 PROM1O43490 865 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 EDF1O60869 148 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 AMY2BP19961 511 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTA1-201ENST00000368147 PSMB5P28074 263 aa6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 111.6 ms