RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 COG8Q96MW5 612 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 ADOQ96SZ5 270 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 FAM86C1Q9NVL1 165 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 KCNIP1Q9NZI2 227 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 VDAC3Q9Y277 283 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 DOT1LQ8TEK3 1739 aa19.06■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 NOTOA8MTQ0 251 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF28P17035 718 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 GABRB3P28472 473 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 RAB11FIP2Q7L804 512 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 NAT6Q93015 286 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 OR5B2Q96R09 309 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 BLACEA4D250 179 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 NPIPA7E9PJI5 369 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 DNAJB6O75190 326 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 NPIPA8P0DM63 369 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 CHMP24386 653 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 ADH6P28332 368 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 CA5AP35218 305 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 CLEC14AQ86T13 490 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 OR5H2Q8NGV7 314 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 OR5K2Q8NHB8 316 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 GATA6Q92908 595 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 GJB3O75712 270 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 CPMP14384 443 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 PVRP15151 417 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 HTR2AP28223 471 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 FCRLBQ6BAA4 426 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 OR52D1Q9H346 318 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 STARD5Q9NSY2 213 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF226Q9NYT6 803 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 LCATP04180 440 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 FASLGP48023 281 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 GSG1LQ6UXU4 331 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 ELMOD2Q8IZ81 293 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 HYLS1Q96M11 299 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 DUSP23Q9BVJ7 150 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 DNTTIP1Q9H147 329 aa19.05■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 FBP2O00757 339 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 LYRM1O43325 122 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 ITGAMP11215 1152 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 PSMB5P28074 263 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 PBX2P40425 430 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 ARF1P84077 181 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 SDR9C7Q8NEX9 313 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 RHBDD1Q8TEB9 315 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 RTP3Q9BQQ7 232 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 BTBD2Q9BX70 525 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 ENPP5Q9UJA9 477 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 ARAFP10398 606 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 SGSHP51688 502 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 YPEL5P62699 121 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 HTRA3P83110 453 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 SRYQ05066 204 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 TUBB3Q13509 450 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 FAM78AQ5JUQ0 283 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 OR7D2Q96RA2 312 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 H7C2Y5 167 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 SULT2B1O00204 365 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 F11P03951 625 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 AKR1C4P17516 323 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 RPE65Q16518 533 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 LYSMD4Q5XG99 296 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 NRG4Q8WWG1 115 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 SLC39A1Q9NY26 324 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 C4BP0C0L5 1744 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 CDK1P06493 297 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 CD6P30203 668 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 HOXC5Q00444 222 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D20Q96BZ9 403 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 INTS14Q96SY0 518 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 CDH20Q9HBT6 801 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 UBQLN4Q9NRR5 601 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 INIPQ9NRY2 104 aa19.04■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 CD63P08962 238 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 HTR3AP46098 478 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 LSSP48449 732 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 SNU13P55769 128 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 PODNL1Q6PEZ8 512 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 KLHDC9Q8NEP7 349 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 EGFP01133 1207 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 SYPL1Q16563 259 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 PGBD5Q8N414 524 aa19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
CCSAP-203ENST00000366687 RLN3Q8WXF3 142 aa19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms