RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352068.5

SNX15-201, Transcript of sorting nexin 15, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SNX15, Length 771 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15-201ENST00000352068 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
SNX15-201ENST00000352068 RAB1BQ9H0U4 201 aa10.66□□□□□ -0.7
SNX15-201ENST00000352068 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
SNX15-201ENST00000352068 TRAV20A0A0B4J274 112 aa10.65□□□□□ -0.7
SNX15-201ENST00000352068 M0R1B8 84 aa10.65□□□□□ -0.7
SNX15-201ENST00000352068 TNFSF11O14788 317 aa10.65□□□□□ -0.7
SNX15-201ENST00000352068 EEDO75530 441 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SNX15-201ENST00000352068 PDE5AO76074 875 aa10.65□□□□□ -0.7
SNX15-201ENST00000352068 YES1P07947 543 aa10.65□□□□□ -0.7
SNX15-201ENST00000352068 IFNGR1P15260 489 aa10.65□□□□□ -0.7
SNX15-201ENST00000352068 PORP16435 677 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
SNX15-201ENST00000352068 COX5AP20674 150 aa10.65□□□□□ -0.7
SNX15-201ENST00000352068 SERPINB1P30740 379 aa10.65□□□□□ -0.7
SNX15-201ENST00000352068 SSTR1P30872 391 aa10.65□□□□□ -0.7
SNX15-201ENST00000352068 EVI2BP34910 448 aa10.65□□□□□ -0.7
SNX15-201ENST00000352068 XKP51811 444 aa10.65□□□□□ -0.7
SNX15-201ENST00000352068 PSPHP78330 225 aa10.65□□□□□ -0.7
SNX15-201ENST00000352068 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa10.65□□□□□ -0.7
SNX15-201ENST00000352068 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SNX15-201ENST00000352068 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
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SNX15-201ENST00000352068 ANKMY2Q8IV38 441 aa10.65□□□□□ -0.7
SNX15-201ENST00000352068 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
SNX15-201ENST00000352068 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa10.65□□□□□ -0.7
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SNX15-201ENST00000352068 OSTF1Q92882 214 aa10.65□□□□□ -0.7
SNX15-201ENST00000352068 UBE2FQ969M7 185 aa10.65□□□□□ -0.7
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SNX15-201ENST00000352068 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
SNX15-201ENST00000352068 ZNF639Q9UID6 485 aa10.65□□□□□ -0.7
SNX15-201ENST00000352068 ZNF180Q9UJW8 692 aa10.65□□□□□ -0.7
SNX15-201ENST00000352068 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
SNX15-201ENST00000352068 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
SNX15-201ENST00000352068 PLLPQ9Y342 182 aa10.65□□□□□ -0.7
SNX15-201ENST00000352068 SLC25A15Q9Y619 301 aa10.65□□□□□ -0.7
SNX15-201ENST00000352068 LOC100653049A0A140TA62 436 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 PLPP1O14494 284 aa10.64□□□□□ -0.71
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SNX15-201ENST00000352068 PGRMC2O15173 223 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 ATP8B1O43520 1251 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 SCO2O43819 266 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 BANF1O75531 89 aa10.64□□□□□ -0.71
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SNX15-201ENST00000352068 AVPP01185 164 aa10.64□□□□□ -0.71
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SNX15-201ENST00000352068 CPMP14384 443 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 ZNF17P17021 662 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 IGHV1-2P23083 117 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 HSD17B3P37058 310 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 OR3A2P47893 321 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 PPOXP50336 477 aa10.64□□□□□ -0.71
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SNX15-201ENST00000352068 CARD18P57730 90 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 RAC1P63000 192 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 SLC29A2Q14542 456 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 CYP20A1Q6UW02 462 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 LRIG3Q6UXM1 1119 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 REC114Q7Z4M0 266 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 OR52N5Q8NH56 324 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 CPNE1Q99829 537 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 BRINP2Q9C0B6 783 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 LPAR2Q9HBW0 351 aa10.64□□□□□ -0.71
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SNX15-201ENST00000352068 SLC17A6Q9P2U8 582 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 OARD1Q9Y530 152 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 MMP24Q9Y5R2 645 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 A0A0A6YYD5 115 aa10.63□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 A0A0J9YW62 118 aa10.63□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 B9A039 149 aa10.63□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 NDUFB5O43674 189 aa10.63□□□□□ -0.71
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SNX15-201ENST00000352068 TFP02787 698 aa10.63□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 SERPINF1P36955 418 aa10.63□□□□□ -0.71
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SNX15-201ENST00000352068 MGAT2Q10469 447 aa10.63□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 TBCCQ15814 346 aa10.63□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 SH2D4BQ5SQS7 431 aa10.63□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 GRTP1Q5TC63 336 aa10.63□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 FAM111BQ6SJ93 734 aa10.63□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 CCDC91Q7Z6B0 441 aa10.63□□□□□ -0.71
SNX15-201ENST00000352068 LAS2Q8IYD9 372 aa10.63□□□□□ -0.71
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