RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299608.6

TMX3-201, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMX3, Length 4,927 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3-201ENST00000299608 NPPBP16860 134 aa10□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 CSNK1G2P78368 415 aa10□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 TNFRSF17Q02223 184 aa10□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 KCNAB1Q14722 419 aa10□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 UGT8Q16880 541 aa10□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 METRNLQ641Q3 311 aa10□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 ZNF367Q7RTV3 350 aa10□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 SERPINA11Q86U17 422 aa10□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 LAS2Q8IYD9 372 aa10□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 CLMPQ9H6B4 373 aa10□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa10□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 KCNS2Q9ULS6 477 aa10□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 TRAV27A0A087WT01 109 aa10□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 ARNTLO00327 626 aa10□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 YKT6O15498 198 aa10□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 THBS2P35442 1172 aa10□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 MMP21Q8N119 569 aa10□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 GOLM1Q8NBJ4 401 aa10□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 OR9K2Q8NGE7 335 aa10□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 CITED4Q96RK1 184 aa10□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 NRSN2Q9GZP1 204 aa10□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 DPAGT1Q9H3H5 408 aa10□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 KLHL21Q9UJP4 597 aa10□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa10□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 FBXL3Q9UKT7 428 aa10□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 MGAT4AQ9UM21 535 aa10□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 KRBA1A5PL33 1030 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 ANKRD28O15084 1053 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 CSNK1A1P48729 337 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 BCL2L15Q5TBC7 163 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 KIAA1211LQ6NV74 962 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 SPEM1Q8N4L4 309 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 METTL25Q8N6Q8 603 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 DNAAF1Q8NEP3 725 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 CCDC74AQ96AQ1 378 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 MS4A8Q9BY19 250 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 TWSG1Q9GZX9 223 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 EPHX3Q9H6B9 360 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 COL18A1P39060 1754 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 OR14I1A6ND48 311 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 TRIM64A6NGJ6 449 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 DLGAP1O14490 977 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 CHRM4P08173 479 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 MAOAP21397 527 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 CD97P48960 835 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 ZNF750Q32MQ0 723 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 PYCR3Q53H96 274 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 FAM205BPQ63HN1 556 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 TUBA3EQ6PEY2 450 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 PLCZ1Q86YW0 608 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 FAM217AQ8IXS0 508 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 OR14A16Q8NHC5 309 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 ATG4BQ9Y4P1 393 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 FAM183AA6NL82 134 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 SLC1A7O00341 560 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 SLC16A7O60669 478 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 VNN2O95498 520 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 ZNF806P0C7X5 589 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 CRABP1P29762 137 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 MAGEA3P43357 314 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 GLO1Q04760 184 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 CHRFAM7AQ494W8 412 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 TP53I3Q53FA7 332 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 TMEM69Q5SWH9 247 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 ZNF160Q9HCG1 818 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 UCKL1Q9NWZ5 548 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 NUP205Q92621 2012 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 CEP250Q9BV73 2442 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 OR5K3A6NET4 321 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 RRP8O43159 456 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 SYT7O43581 403 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 GTF2F2P13984 249 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 BCL6P41182 706 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 RPS5P46782 204 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 NKX3-2P78367 333 aa9.99□□□□□ -0.81
TMX3-201ENST00000299608 BCL7AQ4VC05 210 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.8 ms