RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 HACD4Q5VWC8 232 aa22.75■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 CBLL1Q75N03 491 aa22.75■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 NLGN4XQ8N0W4 816 aa22.75■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa22.75■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 NOX3Q9HBY0 568 aa22.75■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 SULT1C2O00338 296 aa22.75■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 RPS2P15880 293 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 BCL7AQ4VC05 210 aa22.75■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 TTC9BQ8N6N2 239 aa22.75■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa22.75■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa22.75■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 OR6C6A6NF89 314 aa22.75■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 NPIPA7E9PJI5 369 aa22.75■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 NPIPA8P0DM63 369 aa22.75■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 GAAP10253 952 aa22.75■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 PRKACAP17612 351 aa22.75■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR26Q8NDV2 337 aa22.75■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM40Q8WWA1 233 aa22.75■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 CDS1Q92903 461 aa22.75■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa22.75■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 SGCZQ96LD1 299 aa22.75■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP6CO00743 305 aa22.74■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 TCTE1Q5JU00 501 aa22.74■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 MROH6A6NGR9 719 aa22.74■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 A6NIZ1 184 aa22.74■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 DAP3P51398 398 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 RAP1BP61224 184 aa22.74■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 RAP1AP62834 184 aa22.74■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa22.74■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 PIANPQ8IYJ0 282 aa22.74■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 DNAJC22Q8N4W6 341 aa22.74■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa22.74■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 CHATP28329 748 aa22.74■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 DCST2Q5T1A1 773 aa22.74■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 PODNL1Q6PEZ8 512 aa22.74■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 USP53Q70EK8 1073 aa22.74■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 OR14A2Q96R54 314 aa22.74■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 SPIN2AQ99865 258 aa22.74■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa22.74■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa22.74■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 IQCF3P0C7M6 154 aa22.74■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC6A8P48029 635 aa22.74■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 PDZD3Q86UT5 571 aa22.74■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 IL17RDQ8NFM7 739 aa22.74■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 MYADMQ96S97 322 aa22.74■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 A6NIN4 97 aa22.73■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 MEIS3P2A8K0S8 358 aa22.73■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 TGM5O43548 720 aa22.73■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 P04436 131 aa22.73■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 CMTM1Q8IZ96 169 aa22.73■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 PRRT1Q99946 306 aa22.73■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa22.73■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 EGFP01133 1207 aa22.73■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 SSTR2P30874 369 aa22.73■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 MEF2DQ14814 521 aa22.73■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 OR1S1Q8NH92 325 aa22.73■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 MUL1Q969V5 352 aa22.73■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 V9GY05 133 aa22.73■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 CLDN24A6NM45 220 aa22.73■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 MYLIPQ8WY64 445 aa22.73■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 SYT11Q9BT88 431 aa22.73■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 BMP4P12644 408 aa22.73■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa22.73■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa22.73■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 BPIFA2Q96DR5 249 aa22.73■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF160Q9HCG1 818 aa22.73■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 ABRACLQ9P1F3 81 aa22.73■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 RARRES3Q9UL19 164 aa22.73■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa22.73■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 PRSS21Q9Y6M0 314 aa22.73■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 HOXC5Q00444 222 aa22.73■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 RUNX3Q13761 415 aa22.73■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 HYAL4Q2M3T9 481 aa22.73■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 OR7G1Q8NGA0 311 aa22.73■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 PLXDC1Q8IUK5 500 aa22.72■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 CNTN4Q8IWV2 1026 aa22.72■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 INTS14Q96SY0 518 aa22.72■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 FOXK1P85037 733 aa22.72■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 FNDC9Q8TBE3 224 aa22.72■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD28O15084 1053 aa22.72■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 IL1AP01583 271 aa22.72■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF136P52737 540 aa22.72■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 ACVR1CQ8NER5 493 aa22.72■■□□□ 1.23
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC2A12Q8TD20 617 aa22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms