RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GALNT5Q7Z7M9 940 aa21.98■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF619Q8N2I2 560 aa21.98■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa21.98■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PINK1Q9BXM7 581 aa21.98■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SAP130Q9H0E3 1048 aa21.98■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KIAA0513O60268 411 aa21.97■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 UGT2B11O75310 529 aa21.97■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GADD45GO95257 159 aa21.97■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ALPPP05187 535 aa21.97■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 WT1P19544 449 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LIMS1P48059 325 aa21.97■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 APOFQ13790 326 aa21.97■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa21.97■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FLYWCH1Q4VC44 716 aa21.97■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FCRLBQ6BAA4 426 aa21.97■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TCTN3Q6NUS6 607 aa21.97■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 THAP5Q7Z6K1 395 aa21.97■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TSPAN14Q8NG11 270 aa21.97■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KRT84Q9NSB2 600 aa21.97■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NINQ8N4C6 2090 aa21.97■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AHCYL1O43865 530 aa21.96■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MAN1A2O60476 641 aa21.96■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 UGT2B17O75795 530 aa21.96■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LGI1O95970 557 aa21.96■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AK1P00568 194 aa21.96■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IL18R1Q13478 541 aa21.96■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LACC1Q8IV20 430 aa21.96■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR10G2Q8NGC3 310 aa21.96■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR4D11Q8NGI4 311 aa21.96■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR52P1PQ8NH57 321 aa21.96■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR52J3Q8NH60 311 aa21.96■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NXPE2Q96DL1 559 aa21.96■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RLIMQ9NVW2 624 aa21.96■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa21.96■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZFHX4Q86UP3 3567 aa21.96■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FFAR1O14842 300 aa21.96■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ANXA8P13928 327 aa21.96■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ABCD3P28288 659 aa21.96■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EXT1Q16394 746 aa21.96■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF311Q5JNZ3 666 aa21.96■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR4C3Q8NH37 302 aa21.96■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARSGQ96EG1 525 aa21.96■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ADOQ96SZ5 270 aa21.96■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FEVQ99581 238 aa21.96■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AGAP5A6NIR3 686 aa21.95■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TTC36A6NLP5 189 aa21.95■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PCDH17O14917 1159 aa21.95■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZFAND5O76080 213 aa21.95■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RPS6KA3P51812 740 aa21.95■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DCAF7P61962 342 aa21.95■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IL1RL1Q01638 556 aa21.95■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GANABQ14697 944 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TBC1D25Q3MII6 688 aa21.95■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 COLEC12Q5KU26 742 aa21.95■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CLIP4Q8N3C7 705 aa21.95■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC5A8Q8N695 610 aa21.95■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NUBPLQ8TB37 319 aa21.95■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 M1APQ8TC57 530 aa21.95■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OMA1Q96E52 524 aa21.95■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PSD2Q9BQI7 771 aa21.95■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DEFB126Q9BYW3 111 aa21.95■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GRIP2Q9C0E4 1043 aa21.95■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RIBC2Q9H4K1 309 aa21.95■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MMP25Q9NPA2 562 aa21.95■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa21.95■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SYT5O00445 386 aa21.94■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TO15178 435 aa21.94■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FRS3O43559 492 aa21.94■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 REM1O75628 298 aa21.94■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NADKO95544 446 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NR1H2P55055 460 aa21.94■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SMIM11AP58511 58 aa21.94■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PLCXD2Q0VAA5 305 aa21.94■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CLN3Q13286 438 aa21.94■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DECR1Q16698 335 aa21.94■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PDZK1Q5T2W1 519 aa21.94■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF836Q6ZNA1 936 aa21.94■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF614Q8N883 585 aa21.94■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DHRS1Q96LJ7 313 aa21.94■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ING2Q9H160 280 aa21.94■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ACAD8Q9UKU7 415 aa21.94■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FRYQ5TBA9 3013 aa21.94■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRIM64A6NGJ6 449 aa21.94■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 M0R3H8 397 aa21.94■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BCKDKO14874 412 aa21.94■■□□□ 1.1
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR2J2O76002 312 aa21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms