RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000173740.1

Lgr5-208, Transcript of Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mouse

TSL 5 BASIC

Gene Lgr5, Length 2,508 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Hspb3	Q9QZ57	154 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Sema4g	Q9WUH7	837 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Srpk3	Q9Z0G2	565 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Agrn	A2ASQ1	1950 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Trav1	A0A075B5Z4	110 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Smurf2	A2A5Z6	748 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gm595	A2AF73	655 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr1095	A3KPP7	308 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Vmn1r20	K7N778	303 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ugdh	O70475	493 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Sp3	O70494	783 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Orm2	P07361	207 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Fth1	P09528	182 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Cfp	P11680	464 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gria1	P23818	907 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Cdh4	P39038	913 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ahcy	P50247	432 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Tango2	P54797	276 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Tra2b	P62996	288 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gpat2	Q14DK4	801 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Nkapl	Q5SZT7	395 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Glt8d2	Q640P4	349 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Cdh24	Q6PFX6	781 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Trim45	Q6PFY8	580 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Rpl35	Q6ZWV7	123 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr1101	Q7TR59	310 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr857	Q7TRF7	309 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Slc39a9	Q8BFU1	308 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Pgs1	Q8BHF7	553 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ckap4	Q8BMK4	575 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Derl2	Q8BNI4	239 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Fbxw14	Q8C2Y5	466 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Pias2	Q8C5D8	621 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Piwil2	Q8CDG1	971 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ppp1r8	Q8R3G1	351 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr1033	Q8VFK5	310 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Snx11	Q91WL6	271 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Atp6v1c2	Q99L60	427 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Kdelr2	Q9CQM2	212 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Mtpap	Q9D0D3	585 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Spaca7	Q9D2S4	182 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Trmu	Q9DAT5	417 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Med27	Q9DB40	311 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Papln	Q9EPX2	1280 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Hacl1	Q9QXE0	581 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	March7	Q9WV66	693 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Skp2	Q9Z0Z3	424 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Cacna1h	O88427	2365 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Fer1l4	A3KGK3	1992 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Speg	Q62407	3262 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Zfp600	A2A7V0	737 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Zfp993	A2A8V4	313 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Il20rb	E9Q9A6	308 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr738	L7N1X7	311 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Stxbp1	O08599	594 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Cops3	O88543	423 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gcat	O88986	416 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Tmco2	P0C1V4	183 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Hrh3	P58406	445 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Hnrnpk	P61979	463 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Vasp	P70460	375 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr629	Q0VBH3	314 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Lvrn	Q2KHK3	559 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr616	Q3KPB0	317 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ankrd42	Q3V096	527 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Cldn34b4	Q3V0X2	211 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Tm7sf2	Q71KT5	418 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Atg4d	Q8BGV9	474 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ppwd1	Q8CEC6	646 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Spns1	Q8R0G7	528 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ing3	Q8VEK6	421 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr330	Q8VGD9	315 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Sp7	Q8VI67	428 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Glyat	Q91XE0	296 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	4933421I07Rik	Q9D420	214 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ptges3l	Q9D9A7	131 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Hgfac	Q9R098	653 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Psma4	Q9R1P0	261 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Vcan	Q62059	3357 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Cd300ld4	A2A7W1	245 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	4930595M18Rik	A2RRY9	829 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Fam84b	D3YXJ5	310 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Catsperg1	E9Q355	1151 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gm8879	F6R3J9	157 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Fbxw9	F8VPX2	458 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ppt2	O35448	302 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gypa	P14220	168 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Cers1	P27545	350 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Nup43	P59235	380 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Fgf1	P61148	155 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ccdc190	Q3URK1	288 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	C1orf109	Q499E6	217 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Musk	Q61006	868 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Cd300ld3	Q6SJQ5	245 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr503	Q7TRU8	323 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Fam69c	Q8BQT2	410 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Hs3st5	Q8BSL4	346 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Slc24a5	Q8C261	501 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Unc5d	Q8K1S2	956 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Psat1	Q99K85	370 aa		10.78	□□□□□ -0.68

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41.3 ms