RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636751.2

TCF4-280, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 8,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-280	ENST00000636751	CPTP	Q5TA50	214 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	MITD1	Q8WV92	249 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SGCZ	Q96LD1	299 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	MMP27	Q9H306	513 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	MED13	Q9UHV7	2174 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	RGS13	O14921	159 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	GTF2F2	P13984	249 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	MMP12	P39900	470 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	GABRA2	P47869	451 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SLC15A4	Q8N697	577 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	MRAP	Q8TCY5	172 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	CENPM	Q9NSP4	180 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ADAMDEC1	O15204	470 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	NUAK1	O60285	661 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	TRAPPC6A	O75865	159 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SYNGR4	O95473	234 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	THBS1	P07996	1170 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SLC6A2	P23975	617 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ACRV1	P26436	265 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	CRAT	P43155	626 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	KCNJ1	P48048	391 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SEC24C	P53992	1094 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	MC2R	Q01718	297 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	PKP1	Q13835	747 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	PCK2	Q16822	640 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SHE	Q5VZ18	495 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ELOA3	Q8NG57	546 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	OR1F2P	Q96R84	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF175	Q9Y473	711 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	OARD1	Q9Y530	152 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	VNN1	O95497	513 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	EBLN1	P0CF75	366 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	CERS1	P27544	350 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	HSD11B2	P80365	405 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	AVPI1	Q5T686	147 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ISOC1	Q96CN7	298 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	RAB39B	Q96DA2	213 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	PAFAH2	Q99487	392 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	FZD3	Q9NPG1	666 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	TCF21	O43680	179 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	OR6B1	O95007	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	CH25H	O95992	272 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	LDLR	P01130	860 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	OR10J4	P0C629	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	BGN	P21810	368 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ITGB8	P26012	769 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ID4	P47928	161 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	C21orf58	P58505	322 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	CEBPE	Q15744	281 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	OPN5	Q6U736	354 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751		Q6ZNX1	250 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-280	ENST00000636751	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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