RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602516.1

HCG18-244, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

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Gene HCG18, Length 2,890 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-244ENST00000602516 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 SKP2Q13309 424 aa7.15□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 LAPTM4AQ15012 233 aa7.15□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 RNF165Q6ZSG1 346 aa7.15□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 PXKQ7Z7A4 578 aa7.15□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 TMEM199Q8N511 208 aa7.15□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 OR13F1Q8NGS4 319 aa7.15□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 SLAMF9Q96A28 289 aa7.15□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 ALG14Q96F25 216 aa7.15□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 C3orf30Q96M34 536 aa7.15□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 NPAS2Q99743 824 aa7.15□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa7.15□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 LHX9Q9NQ69 397 aa7.15□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 LHX3Q9UBR4 397 aa7.15□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 IKZF3Q9UKT9 509 aa7.15□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 PSMD13Q9UNM6 376 aa7.15□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa7.15□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa7.15□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 SCN8AQ9UQD0 1980 aa7.15□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 OIP5O43482 229 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 HEPACAMQ14CZ8 416 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 KDM4DQ6B0I6 523 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 GDPD4Q6W3E5 623 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 HACD2Q6Y1H2 254 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 Q6ZNB5 142 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 PIANPQ8IYJ0 282 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 SLC39A11Q8N1S5 342 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 PQLC1Q8N2U9 271 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 DNAJC22Q8N4W6 341 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 DNAJB14Q8TBM8 379 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 C2CD4CQ8TF44 421 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 CORO2AQ92828 525 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 CDS1Q92903 461 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 RAB24Q969Q5 203 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 SMIM14Q96QK8 99 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 FAM129BQ96TA1 746 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 FEM1AQ9BSK4 669 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 NT5DC2Q9H857 520 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 SLAMF7Q9NQ25 335 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 TAS2R9Q9NYW1 312 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 PACSIN3Q9UKS6 424 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 FIS1Q9Y3D6 152 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 HSPB11Q9Y547 144 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 CROCCQ5TZA2 2017 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 A0A0U1RQS6 177 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 SUPT3HB4E1H0 165 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 SMLR1H3BR10 107 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 HRKO00198 91 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 PPP6CO00743 305 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 ALPLP05186 524 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 ALPPP05187 535 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 ALPPL2P10696 532 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 TSPAN8P19075 237 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 GPX3P22352 226 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 GLRA1P23415 457 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 SSTR2P30874 369 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 RPS5P46782 204 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 TTPAP49638 278 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 CEBPGP53567 150 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 EPHB3P54753 998 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 ZXDBP98169 803 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 EPS8Q12929 822 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 ARL6IP1Q15041 203 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 SF1Q15637 639 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 EOGTQ5NDL2 527 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 CTSL3PQ5NE16 218 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 KRT80Q6KB66 452 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 LINGO2Q7L985 606 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 DEFB128Q7Z7B8 93 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 CYGBQ8WWM9 190 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 DPF1Q92782 380 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 CHRDQ9H2X0 955 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.14□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 GALPQ9UBC7 116 aa7.14□□□□□ -1.27
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