RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 MACROD1Q9BQ69 325 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 DAPP1Q9UN19 280 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC22A7Q9Y694 548 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 CLDN25C9JDP6 229 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 LCKP06239 509 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 MAGP20916 626 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 MC3RP41968 323 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 ST3GAL4Q11206 333 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 CASP12Q6UXS9 341 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 OR2L13Q8N349 312 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 OR9A2Q8NGT5 310 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF675Q8TD23 568 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A087WV62 115 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A0J9YY10 115 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 POU2F1P14859 743 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 GPLD1P80108 840 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR18Q14330 331 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 NCF4Q15080 339 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 PLAG1Q6DJT9 500 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 MFSD12Q6NUT3 480 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 PODNL1Q6PEZ8 512 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 Q6ZNX1 250 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 LACC1Q8IV20 430 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 AVL9Q8NBF6 648 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 MORN4Q8NDC4 146 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 B3GNT7Q8NFL0 401 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 ADAMTS15Q8TE58 950 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 DPYSL5Q9BPU6 564 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 ETAA1Q9NY74 926 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 CPNE7Q9UBL6 633 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 MKLN1Q9UL63 735 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 KLHL20Q9Y2M5 609 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-204ENST00000587718 CFAP46Q8IYW2 2715 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 M0R082 166 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 EPPINO95925 133 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 ADORA3P0DMS8 318 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 ALOX12P18054 663 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 TRAM2Q15035 370 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF311Q5JNZ3 666 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM71Q6P5X7 295 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 C16orf62Q7Z3J2 963 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM26EQ8N5C1 309 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 OR6T1Q8NGN1 323 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 IRGMA1A4Y4 181 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 OR6C74A6NCV1 312 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 WASHC1A8K0Z3 465 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 EFCAB9A8MZ26 197 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 M0R3H8 397 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 CTSVO60911 334 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 STATHP02808 62 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 STSP08842 583 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 CD82P27701 267 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 RHAGQ02094 409 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 OR4K5Q8NGD3 323 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 C16orf58Q96GQ5 468 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 SEMA4CQ9C0C4 833 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR83Q9NYM4 423 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 OSGIN1Q9UJX0 560 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 AK1P00568 194 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 THBS1P07996 1170 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 GSSP48637 474 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 HHEXQ03014 270 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 ST3GAL3Q11203 375 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF750Q32MQ0 723 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 USP43Q70EL4 1123 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 MRGPREQ86SM8 312 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 KBTBD8Q8NFY9 601 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC38A3Q99624 504 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 PRRG3Q9BZD7 231 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 AKIP1Q9NQ31 210 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC88CQ9P219 2028 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 AIREO43918 545 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 TP53P04637 393 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 GUSBP08236 651 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-204ENST00000587718 C8orf89P0DMQ9 161 aa23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms