RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582376.1

GGA3-212, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 551 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-212ENST00000582376 VPS41P49754 854 aa8.06□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 GPX6P59796 221 aa8.06□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 DUSP2Q05923 314 aa8.06□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 CRYMQ14894 314 aa8.06□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 SH2D4BQ5SQS7 431 aa8.06□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 GRHL2Q6ISB3 625 aa8.06□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 NPSR1Q6W5P4 371 aa8.06□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 FCRLAQ7L513 359 aa8.06□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa8.06□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 MARCH3Q86UD3 253 aa8.06□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 C1QL4Q86Z23 238 aa8.06□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 VSTM4Q8IW00 320 aa8.06□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP8.06□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 TXLNBQ8N3L3 684 aa8.06□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP8.06□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 FAHD2AQ96GK7 314 aa8.06□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 HES6Q96HZ4 224 aa8.06□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 KLHL15Q96M94 604 aa8.06□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 GBP4Q96PP9 640 aa8.06□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 RTN4RQ9BZR6 473 aa8.06□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 TMEM185BQ9H7F4 350 aa8.06□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 NTN4Q9HB63 628 aa8.06□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 LPAR2Q9HBW0 351 aa8.06□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 TIGARQ9NQ88 270 aa8.06□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 OR10H1Q9Y4A9 318 aa8.06□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 A0A087WZY1 265 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 CIB4A0PJX0 185 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 KERAO60938 352 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 CLDN9O95484 217 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 MBD3O95983 291 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 PNPP00491 289 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 NUDT17P0C025 328 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 IFNGR1P15260 489 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 PGAM1P18669 254 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 KCNJ1P48048 391 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 PPOXP50336 477 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 C17orf67Q0P5P2 114 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 CUL3Q13618 768 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 RIN1Q13671 783 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 ZNF460Q14592 562 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 LTB4RQ15722 352 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 CDKL4Q5MAI5 379 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 C1QL2Q7Z5L3 287 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 ZNF786Q8N393 782 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 OR4N2Q8NGD1 307 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 OR51F2Q8NH61 342 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 ANKRD49Q8WVL7 239 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 SIGLEC10Q96LC7 697 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 RNF145Q96MT1 663 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 VSTM2LQ96N03 204 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 SRXN1Q9BYN0 137 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 LACRTQ9GZZ8 138 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 FLRT3Q9NZU0 649 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 NTMQ9P121 344 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 CES1P1Q9UKY3 287 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 TRAF6Q9Y4K3 522 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 B9A039 149 aa8.04□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa8.04□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 PIN1P1O15428 100 aa8.04□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 NME6O75414 186 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 VSIG8P0DPA2 414 aa8.04□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 EDNRAP25101 427 aa8.04□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 SFTPDP35247 375 aa8.04□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 SERPINF1P36955 418 aa8.04□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 MAGEA3P43357 314 aa8.04□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 KHKP50053 298 aa8.04□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa8.04□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 CPTPQ5TA50 214 aa8.04□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 SLC48A1Q6P1K1 146 aa8.04□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 SPATA19Q7Z5L4 167 aa8.04□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 ZNF100Q8IYN0 542 aa8.04□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 SLC43A2Q8N370 569 aa8.04□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 CDYL2Q8N8U2 506 aa8.04□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 WDR60Q8WVS4 1066 aa8.04□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 CCT8L2Q96SF2 557 aa8.04□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 NPAS1Q99742 590 aa8.04□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 CD244Q9BZW8 370 aa8.04□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 CXorf36Q9H7Y0 433 aa8.04□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 ANKRA2Q9H9E1 313 aa8.04□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 BCO1Q9HAY6 547 aa8.04□□□□□ -1.12
GGA3-212ENST00000582376 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms